αシヌクレイン凝集形成の多様性について真面目に検証
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αシヌクレイン（α-synuclein, α-syn）は、パーキンソン病、レビィ小体型認知症、多系統萎縮症など、シヌクレイノパチーの主要病理タンパクとして研究が進められており、 α-syn凝集体の多様性が疾患や病理の多様 […]
投稿者: mom
COVID19ワクチンに期待: モデルナ
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先週月曜日のPfizer／BioNTechのCOVID19ワクチンについてのアナウンスメント[1, 2]に続き、 先週水曜日にロシアのワクチン（Sputnik V）[3]、 今週月曜日にアメリカModerna社のワクチン […]
タグを一括編集
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新しいタグを、そのキーワードを踏む投稿全てに一括で追加したい場合。 1. 追加したいタグの名称で検索 1-1. 投稿＞投稿一覧＞検索 1-2. もし、全ての検索結果が１ページに表示されない場合は、右上の「表示オプション」 […]
Club House KYK
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「できた！できたよー！」 と言って、先日、長女（７歳）が書斎に飛び込んできました。 「何ができたの？」 と聞くと、 「Club House KYKの歌だよ。」 という返事。 …はて、Club House K […]
ADリスク遺伝子多型を持つ人は若い頃から海馬が小さくなる
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）には、これまで多くのリスク遺伝子が報告されており、特にAPOE4は最も強力なリスク多型と言われています。 ADのリスク遺伝子ランキング（Alzform/T […]
【ImageJ/Fiji】Colocalization算出（Striatum, spine markers）
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Colocalization Assay 1. Confocal microscopeで撮影した […]
COVID19ワクチンに期待: ファイザー/BioNTech
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今週月曜日、PfizerとBioNTechから、COVID19に対する新規ワクチンの効果についてのアナウンスメントがありました。[1, 2] このワクチン、現在Phase 3が進行中ですが、現時点で90%の予防効果がある […]
画像の遅延読み込み（Lazy Load）
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地道にサイトの高速化実施中。 今回取り組んだのは、画像の遅延読み込み「Lazy Load」。 プラグインで。 Lazy Loadのプラグインは色々あるが、今回は 有効インストール数が多い 更新頻度が高い 現在使用中のSP […]
ヒトの野生型APP遺伝子ノックインマウス
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）の２大病理タンパクであるアミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）と過リン酸化タウ。 アミロイド仮説の提唱とともに、多くの変異アミロイド前駆体蛋白質 […]
【Rで作図】バイオリン・プロット（Violin plot）
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データをグラフにするとき、 「これのデータは バイオリン プロット で表すのが最適。」 と思う時があります。 今回は、それを R で作るときの備忘録。 ggplot2 のインストール ggplot2 は、“The Gra […]
WordPress記事内の文字を一括で置換する
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蓄積した記事内の特定の文字を一括で置換したい… という時に便利なプラグイン 「Better Search Replace」 Better Search Replaceの使い方 1. インストール → 有効化 2. 管理画 […]
アメリカ大統領…決定
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アメリカの大統領選挙で、バイデン氏の当選が確実となりました。 テレビはずっとこのレースを放映し、 職場でも 「今どっちが勝ってる？」という話でもちきり。 一時期は 「トランプ氏が勝ちそう」という空気になって […]
固定記事にウィジェットを表示（プラグインで）
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使用したのは、「Page Builder by SiteOrigin」というプラグイン。 Page Builder by SiteOriginの使い方 1. インストール → 有効化 2. 投稿画面に「ペー […]
そのオリゴマー抗体の特異度、大丈夫？
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以前、A53T変異の入ったBAC-SNCA-Tgマウスを解析していた事があり、 その際、α-シヌクレイン（α-syn）のオリゴマー抗体（SynO1）とフィブリル抗体（SynF2）を使って、 α-synのオリゴマーが特定の […]
Tmem106bの完全欠損はFTLD-GRNマウスのフェノタイプを増悪させる
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今回は、前頭側頭葉変性症（Frontotemporal lobar degeneration, FTLD）の約半数を占める 「TDP43凝集体を伴うFTLD（FTLD-TDP）」 …に深く関与する、 Progranuli […]
投稿者名を非表示に
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セキュリティー上、個人ブログの投稿者名は非表示にしておいた方が良い… という事で、今までは「Show and Hide Author」というプラグインを使っていましたが、プラグインなしでも簡単にできそうだったので、やって […]
RCR③：Authorship（オーサーシップ）
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私の所属する大学の必須トレーニングの一つに、Responsible Conduct of Research (RCR) についてのトレーニングがあります。 CITIという機関のRCRプログラムを受け、合格すると証書が与え […]
アメリカ大統領選挙…間近
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11月3日は、アメリカ大統領総選挙の日です。 この日に向けて、 トランプ氏、バイデン氏、両陣営の激しい総力戦が続いています。 アメリカの選挙戦で驚いたのは、 かなりのネガティブ・キャンペーン合戦なこと。 & […]
ハロウィン－2020
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毎年子供達の騒ぎ声で賑やかなハロウィン。 COVID2019の自宅謹慎は若干緩やかになったものの、 このようなイベント系は自粛するべきかどうか、 ずっと迷っていました。 近所の飾りを見ても、 装飾度合いがか […]
【ImageJ/Fiji】Striatum の Spine density のカウント
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Spine DensityのCount（cell countにも使える） Confocal microsc […]
Aβプラークの新しいタイプーcoarse-grained plaqueー
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）の２大病理といえば、 アミロイドβ（Aβ）プラークと神経原線維変化（NFT）ですが、 Aβプラークには、その形態や構成Aβによって、いくつかの種類に分類さ […]
noindex / nofollow / sponsored / ugc …どうする？
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SEO対策で noindex／nofollow／sponsored／ugc の設定をちゃんとした方がいい… ということで、 内容をまとめました。 そもそも私のブログは自分用の要素が強いので、 SEO対策は最 […]
LRRK2はミクログリアの神経毒性を惹起する
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α-シヌクレイン（α-synuclein, α-syn) は、ミクログリアを活性化し、神経障害に関与する事が知られていますが、その詳細なメカニズムについては議論が続いています。 アメリカNIH, NIAのDr. Kim, […]
【Excel】外れ値の検定（Smirnov-Grubbsの棄却検定）
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データの中に、一つだけ他のデータとかけ離れている値がある場合、それを外れ値として棄却するべきかどうか、検定する方法。 スミルノフ・グラブス棄却検定 帰無仮説：この値は外れ値ではない 対立仮説：この値は外れ値である 1. […]
データをじっくりみて考える
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アメリカの新規感染者数は依然として数万人規模と、なかなか厳しい現状が続いています。 そんな中、ラボのミーティングはひたすらオンラインです。 以前、「全員クビ」と叫ばれていたグループミーティングですが、 ポス […]
【ImageJ/Fiji】StriatumのSpineのIntensityの求め方
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Intensityの求め方 Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。C […]
Aβ抗体の持つ、Aβ凝集阻害機能について検証
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1999年にSchenkらの研究グループがアミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）抗体による、ADモデルマウス脳内のAβプラーク消失と認知機能改善を報告 [1] して以来、現在まで多くのAβ抗体が開発され、臨床応 […]
【ImageJ/Fiji】Representative image作成
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Representative Imageの作り方 1. Confocal microscopeで撮影したI […]
【Excel】INDEX関数とMATCH関数を使って、任意のデータを抽出
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違う時期に抽出したデータで、 各行の並びがバラバラになっている事がある。 「嗚呼、こっちのデータとあっちのデータを照合したい…」 という時に便利な関数。 例題 eg. 下記のようなDeta AとData Bがあるとする。 […]
【Rデータ整理】データフレームの最初の行、ディメンジョン、構造を確認する：head／dim／str
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テーブルデータを取り込んだ後は、最初の6行、ディメンジョン、概要などを確認する。 データの取り込み 例えば、 コンソールに下記入力してデータを取り込む。 例えば、Dドライブにある"data.csv"というファイルを取り込 […]
Single-Nucleus RNAシークエンスの落とし穴
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脳内での細胞達の動向をみるために、シングルセルRNAシークエンス（single-cell RNA-Seq, scRNA-Seq）が注目され、 これまで、マウス脳内やヒト脳内での各細胞のheterogeneityについて多 […]
