Rで使う正規表現の色々
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Rでよく使う正規表現のパターンを、カテゴリー別に整理してみた。 Rで使用する正規表現いろいろ 文字の検索・位置指定に関するパターン パターン 説明 例 ^ 文字列の先頭を指定 ^Hello は "Hello World" […]
「備忘録」の記事一覧
【RMarkdownトラブルシュート】Error: pandoc document conversion failed with error 1
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RMarkdownをwordファイルにknitしようとしたとき、下記エラーメッセージが出て止まってしまった。 Error: pandoc document conversion failed with error 1 こ […]
【Google Search Console】HTTP marked with canonical tag
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先日、日録のカテゴリーをサブドメインに移動した。 思っていたよりも簡単にできたけど、SEO的に必要な項目を抑えているかどうか不安が残るところ。 とゆーことで、サブドメインに記事を移動した後、ちょくちょく ”Google […]
【VSCode】VSCodeにGitHub Copilotを導入
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先日、RStudioにGitHub Copilotを入れて、かなり使いやすいと感じたので、 （順番が逆ですが）VS Codeにも導入することにしました。 以下、導入方法と使い方についてまとめておきます。 事前準備 事前準 […]
【RStudio】RStudio に GitHub Copilot と chattr を取り込む
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折角GitHubの設定を行ったので、この機会に「GitHub Copilot」をRStudioに導入し、ついでに、毎日ブラウザでお世話になっている「ChatGPT」もRStudioに入れてみることにしました。 「どっちか […]
【RStudio】GitHubのブランチ（Branch）を作って作業する
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RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまでの道のり。 RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまで RとRStudioのインストール Gitのインストール RStudioの情報をGitへ […]
【RStudio】GitHubのリポジトリからRStudioに「Pull」
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RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまでの道のり。 RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまで RとRStudioのインストール Gitのインストール RStudioの情報をGitへ […]
【RStudio】RStudioで作成したスクリプトを「Commit」→「GitHubにPush」
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RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまでの道のり。 RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまで RとRStudioのインストール Gitのインストール RStudioの情報をGitへ […]
【RStudio】RStudio を GitHub と連携
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RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまでの道のり。 RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまで RとRStudioのインストール Gitのインストール RStudioの情報をGitへ […]
【RStudio】RStudio を Git と連携
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RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまでの道のり。 RStudioとGitHubを連携させて使えるようになるまで RとRStudioのインストール Gitのインストール RStudioの情報をGitへ […]
【Rで作表】{knitr}パッケージのkable()と{kableExtra}パッケージの組み合わせ
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作表で使われるのは、{knitr}パッケージのkable()(=kbl())と{kableExra}パッケージの組み合わせや、{gt}パッケージ等。 臨床論文の最初に出てくる「Table1」を作るときにはtableone […]
【R Markdown】コードを隠す
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例えば、R Markdownで簡単な表を作った場合、 ```{r} df_6h <- data.frame("1"=c("Cont_6h_1","LPS_6h_1"), "2"=c("Cont_6h_2","LPS […]
Git／GitHubの環境構築
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これまで、Rのスクリプトやプロジェクトの管理を、職場のサーバーに諸々保存して、リモートデスクトップで編集して、、、とゆー感じでやっていました。 けれど、新しい職場はセキュリティ対策的なもので、しょっちゅうネットワークがリ […]
【Outlook】送信メールの取り消し/やり直し
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メールを送信した後で、「しまった！間違えた！」という時がある。 Gmailだったら、完全送信までに30秒間の猶予を与えてくれるけど、Outlookの場合はそのまま送ってしまうよう。 でも、相手が未読の状態だったら、「送信 […]
【Google Sheet】カレンダー（Date Picker）を表示する
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グループ内でのスケジュール管理などに何かと便利なGoogle Sheet。 日付をカレンダーからピックアップしたいときは、Date Pickerにしておくと便利。 Date pickerの表示方法 1．対象のセルを選択。 […]
【Rトラブルシュート】Error: package or namespace load failed for ‘tidyr’ in loadNamespace(j - i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]): namespace ‘cli’ 3.3.0 is already loaded, but >= 3.6.1 is required
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”tidyverse"のfunctionがない、というエラーメッセージが出たので、アンインストール／再インストールを試みた。 remove.packages("tidyverse") install.packages(" […]
【Excel】CSVファイルが文字化けする時
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必要なデータをCSVファイルとしてダウンロードした時、時々文字化けして困ることがある。 これは、文字コードの違いであることがほとんど。 文字コードの違いが原因かどうか確認する方法 文字化けの原因が文字コードの違 […]
【Rトラブルシュート】Error in make.names(col.names, unique = TRUE) : invalid multibyte string at ‘83>|81>[‘
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read.csvでダウンロードしたCSVファイルを開こうとしたら、 read.csv("D:/Downloads/New_file.csv") 下記メッセージ。 Error in make.names(col.names […]
【Rで作図】軸を切断して途中を省略し、軸幅の割合を変える
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ggplotで作った下記グラフ、一番高いバーのせいで、低いバーが見えにくくなっている。 なので、途中で棒をぶった切って、中間部を省略し、さらに上の方は間隔を狭めたい。 ……と思った時の備忘録。 軸を切断して途中を省略し、 […]
【Remote Desktop】画面サイズの最適化
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リモートデスクトップの時、自宅のモニターとサイズが合わず、タスクバーのアイコンを探す時に下にスクロールしなくちゃならなかったりしてちょっとモヤッとする。 こんな時は、「Smart Sizing」を使うと便利。 画面左上を […]
【Rデータ整理】行や列の抽出：subset
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データフレームから、subsetを使って、特定の行や列を抽出する方法。 今回は、下記データ（Data）を使用。 > print(Data) ID Cohort Sex Age ADNC LBDSubtype 1 1 […]
【QuPath】Thresholdで二値化して陽性部分の面積を求める
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例えば、このマウスのIHC画像。 海馬と皮質の部分をそれぞれannotationして、二値化してDAB染色陽性部分の面積を測定したい。 アノテーションを作成する まずは、計測したいエリアを選択して、アノテーションを作成す […]
【Illustrator】オブジェクトの形を歪める
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この血管の図形、内皮細胞がないので、足してみる。 まずは直線でこのような内皮細胞の管をつくる。 これを、ArterioleのBranchに沿って変形させたい。 オブジェクトを歪める この時役に立つのがWarp Tool（ […]
【RStudio】RとRStudioのインストール
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Rは統計解析等に強いプログラミング言語。 RStudioは、Rを使うための総合開発環境（IDE）の一つ。 両方とも無料でダウンロードできる。 Rのダウンロード／インストール Rのダウンロード CRANウェブサイトへ。 私 […]
【Outlook】メールボックスがいっぱいになったと警告を受けたら
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ある時、職場のOutlookのメールボックスに下記のような警告メッセージが届いた。 まだ赴任して1年も経っていないのに、もうメールボックスがいっぱいだなんて……こんなの仕事にならないわ。。。 IT掛に相談す […]
句読点のデフォルト「。、」を「．，」に変更：文字変換ソフトから／Word設定から
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日本語で文章を書くとき、普段使っている句読点は「、。」だけど、日本語の論文では「，．」を使うように指示されることが多い。 その時だけデフォルトを変更する方法の備忘録。 文字変換ソフトウェアのプロパティから変更 私が普段使 […]
【ReadCube Papers】Bibliographyをカスタマイズ
WordにReadCube Papersのアドインを入れて論文を書く今日この頃。 雑誌の規定にあったBibliographyのフォーマットが、リストの中から見つからなかったりする。 今回は、APAのスタイル […]
【Rで作図】Y軸タイトルを2列にする
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ggplot2でグラフを描いたとき、Y軸タイトルを長ーくすると、2列に降りたくなる。 ▲ グラフの中にY軸タイトルが収まりきれない。。。 その方法の備忘録。 Y軸タイトルを2列にして、位置を調整する 正規表現「\n」で改 […]
【Illustrator】配色を変える
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色調のバランスは変えないまま、全体的に配色を変えたい事は多い。 例えば下の細胞の絵でやってみる。 配色を変える 目的のオブジェクトを選択した状態で、 「編集」→「カラーを編集」→「オブジェクトを再配色」 プ […]
【PowerPoint】スライド番号の開始番号を変更
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PowerPointで、スライド番号を挿入することがよくある。 このとき、表紙には番号をつけたくない。 で、表紙を除いた1枚目を「スライド番号『1』」としたい。 スライド番号の挿入（表紙は番号の表示を隠す） スライドナン […]
【WordPress/SEO】記事の引っ越しと、その後に必要な操作
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先日、諸々の事情あり、サブドメインを作って、特定の記事をそちらに移動した。 その際にいくつか必要な操作があったので、忘れないようにメモメモ....φ(･ω･ )。 記事を別サイトへ移動 All-in-One WP Mig […]
【Illustrator】ラインの単純化（アンカーポイントを減らす）
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この血管細胞のイラスト。。。 ダイレクトセレクトで選択してみると、アンカーポイントが無駄に多いのがわかる。 アンカーポイントが多いと、線がガタガタしているし、保存したときに容量も大きくなるので、こんな単純な形はアンカーポ […]
【Outlook】メールの自動振り分け
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Outlookで受信箱にやってきたメールを自動で振り分ける方法 etc.。 メールの自動振り分け 振り分け先のフォルダを作る まずは、振り分け先のフォルダを作る。 受信箱で右クリック → 新規フォルダを選択。 新規フォル […]
【Outlook】日時を指定して送信する
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私は、「できれば休日深夜早朝構わず、必要と思った時にメールを書いてそのまま送信し、後は次のメールがくるまで忘れておきたい」と思うタイプ。 これまでは、私と同じようなタイプの人たちと仕事をすることが多かったた […]
【Outlook】Exchangeでメールを同期
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職場のメールがExchange Serverになったので、自宅PCのOutlookにも同期させることに。 Exchangeに接続 コントロールパネルを開き、右上の「View by」のリストで「Small icons」を選 […]
【RMarkdown】チャンクオプションの色々
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R Markdownのチャンクオプション（include など）は、コードチャンクやその出力の表示方法および動作を制御するために用いる。 これにより、レポートの構成や内容を柔軟にカスタマイズすることが可能となる。 RMa […]