ハロウィン－2020
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毎年子供達の騒ぎ声で賑やかなハロウィン。 COVID2019の自宅謹慎は若干緩やかになったものの、 このようなイベント系は自粛するべきかどうか、 ずっと迷っていました。 近所の飾りを見ても、 装飾度合いがか […]
Month: 2020年10月
【ImageJ/Fiji】Striatum の Spine density のカウント
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Spine DensityのCount（cell countにも使える） Confocal microsc […]
Aβプラークの新しいタイプーcoarse-grained plaqueー
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）の２大病理といえば、 アミロイドβ（Aβ）プラークと神経原線維変化（NFT）ですが、 Aβプラークには、その形態や構成Aβによって、いくつかの種類に分類さ […]
noindex / nofollow / sponsored / ugc …どうする？
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SEO対策で noindex／nofollow／sponsored／ugc の設定をちゃんとした方がいい… ということで、 内容をまとめました。 そもそも私のブログは自分用の要素が強いので、 SEO対策は最 […]
LRRK2はミクログリアの神経毒性を惹起する
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α-シヌクレイン（α-synuclein, α-syn) は、ミクログリアを活性化し、神経障害に関与する事が知られていますが、その詳細なメカニズムについては議論が続いています。 アメリカNIH, NIAのDr. Kim, […]
【Excel】外れ値の検定（Smirnov-Grubbsの棄却検定）
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データの中に、一つだけ他のデータとかけ離れている値がある場合、それを外れ値として棄却するべきかどうか、検定する方法。 スミルノフ・グラブス棄却検定 帰無仮説：この値は外れ値ではない 対立仮説：この値は外れ値である 1. […]
データをじっくりみて考える
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アメリカの新規感染者数は依然として数万人規模と、なかなか厳しい現状が続いています。 そんな中、ラボのミーティングはひたすらオンラインです。 以前、「全員クビ」と叫ばれていたグループミーティングですが、 ポス […]
【ImageJ/Fiji】StriatumのSpineのIntensityの求め方
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Intensityの求め方 Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。C […]
Aβ抗体の持つ、Aβ凝集阻害機能について検証
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1999年にSchenkらの研究グループがアミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）抗体による、ADモデルマウス脳内のAβプラーク消失と認知機能改善を報告 [1] して以来、現在まで多くのAβ抗体が開発され、臨床応 […]
【ImageJ/Fiji】Representative image作成
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以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Representative Imageの作り方 1. Confocal microscopeで撮影したI […]
【Excel】INDEX関数とMATCH関数を使って、任意のデータを抽出
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違う時期に抽出したデータで、 各行の並びがバラバラになっている事がある。 「嗚呼、こっちのデータとあっちのデータを照合したい…」 という時に便利な関数。 例題 eg. 下記のようなDeta AとData Bがあるとする。 […]
【Rデータ整理】データフレームの最初の行、ディメンジョン、構造を確認する：head／dim／str
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テーブルデータを取り込んだ後は、最初の6行、ディメンジョン、概要などを確認する。 データの取り込み 例えば、 コンソールに下記入力してデータを取り込む。 例えば、Dドライブにある"data.csv"というファイルを取り込 […]
Single-Nucleus RNAシークエンスの落とし穴
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脳内での細胞達の動向をみるために、シングルセルRNAシークエンス（single-cell RNA-Seq, scRNA-Seq）が注目され、 これまで、マウス脳内やヒト脳内での各細胞のheterogeneityについて多 […]
【Excel】ピアソン相関係数（r値, t値, p値）
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エクセルでピアソン相関係数を算出する方法 例題 eg. 下記のようなデータがあった場合 r value =PEARSON(データ1の範囲,データ2の範囲) =PEARSON(A2:A28,B2:B28) r = 0.62 […]
RCR②：Data Management（データマネージメント）
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私の所属する大学の必須トレーニングの一つに、Responsible Conduct of Research (RCR) についてのトレーニングがあります。 CITIという機関のRCRプログラムを受け、合格すると証書が与え […]
認知機能低下の一番の要因は混合病理
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心機能障害、糖尿病 (diabetes mellitus, DM)、心血管障害 (cardiovascular disease, CaVD) は、アルツハイマー病病理（Alzheimer's disease neurop […]
【Excel】各セルの名前を一括で追加/削除
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Data analysisから抽出したエクセルデータで、時々各セルの名前を一括変更したい時がある。 名前を削りたい時 例えば、 "D:\Slide Scanner\Scan-200825-BF-409-Hipp-FN-C […]
【Excel】オッズ比とP値
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オッズ比とP値はエクセルで計算可。 X1 X2 Total Y1 a b a+b Y2 c d c+d Total a+c b+d a+b+c+d 上記のようなデータがあった場合、期待値は、 期待値 X1 X2 Tota […]
VCPがタウ凝集体を分解する ー “vacuolar tauopathy”
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valosin-containing protein (VCP) は、全ての真核生物と古細菌などに存在するATPaseで、 ユビキチン－プロテアソーム系（Ubiquitin-proteasome system, UPS） […]
【ImageJ/Fiji】スケールバーを表示
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ImageJ/Fijiでスケールバーを表示する方法。 ……高性能の顕微鏡で撮影した画像には、たいていスケールの情報が入っているので、まずはそちらから。 スケール情報を表示 通常の場合 Fijiで画像を開く> Ana […]
OneDrive, Dropbox, Creative Cloudの保存先を別ドライブに移動
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私は、ドキュメントファイル系はDドライブに入れるように設定していましたが、OneDriveやDropbox等のクラウドストレージの保存先をCドライブにしたままだったため、 Cドライブの容量が少ななくなってきました。 …と […]
RCR①：Reserch Misconduct（研究不正）
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私の所属する大学の必須トレーニングの一つに、Responsible Conduct of Research (RCR) についてのトレーニングがあります。 CITIという機関のRCRプログラムを受け、合格すると証書が与え […]
PD遺伝子変異が特発性レム睡眠行動異常に関連するか
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レム睡眠行動異常（rapid-eye-movement sleep behavior disorder, RBD）は、レム睡眠期の筋緊張低下が消失し、夢の内容によって実際に体が動いてしまう症状です。 RBDとパーキンソン […]
Windows10のXboxを削除
授業中のオンラインゲームが発覚した長男（10歳）。 一時期は、XboxというWindows10のビルトインアプリにハマり、ひたすら友達とチャットしながらゲームをするという なんとも不健康な生活になっていました。 少し前に […]
【Windows】別ユーザーのPCをリモートデスクトップ接続：同時接続（セッションシャドウィング）も
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以前、長男（１０歳）のゲーム中毒疑惑について触れましたが、 この問題が深刻味を帯び、とうとう、オンライン授業中にオンラインゲームやYouTubeをこっそり楽しんでいる事が判明。 オンライン授業のサポートをし […]
Logitech（logicool, ロジクール）キーボード/マウス/トラックボールに複数のデバイスをペアリング
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私は職場で、自分用と解析用に２台の PC を（こっそり）使わせてもらっているのですが、キーボードが２個あると、ちょっと邪魔… とゆーことで、自宅の Logitech Ergo K860 を持ってきて、２台同時にペアリング […]
ウェビナー／カウンセリングを受けて
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私の所属する大学には、世界中からポスドクがやってくるので、 「外国人研究者」のためのセミナーやワークショップなども充実しています。 ある時、 「外国人研究者がコロナ禍で文化の壁をどう乗り越えるか」 というテ […]
FBXO7のヘテロ変異の組み合わせで家族性若年性PD発症
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F-box protein 7 (FBXO7) は、常染色体劣性遺伝型パーキンソニズムの原因遺伝子であるが、そのフェノタイプは様々。 今回、アメリカ・ワシントン大学のDr. Zabetianらの研究グループ […]
特定のカテゴリーだけフロントページ／メニュー／ウェジェットに表示しない
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自分の備忘録的にさらっと読んだだけの論文とか、PC効率化、Worepress備忘録を記事で残しておきたい。 でも、それを全部フロントページに表示していたら、他の記事が押されて、それらの記事でフロントページが埋め尽くされて […]