2020年 今年のブレイクスルー研究（Science）
年の瀬、各誌この１年のブレイクスルーや来年の展望etc.をまとめています。 今回は、Science誌の ”2020 Breakthrough of the Year” から。 待望のワクチン 今年の Breakthrough に選ばれたのは、COVID19ワクチンでした。 2019年12月31日、中国の武漢で、謎のクラスター肺炎が発生していると報告 2020年1月8日、中国の研究者が肺炎の原因ウイ […]
YEAR
2020年
カテゴリー一覧：左にサムネイル、右に抜粋記事
以前、アイコン付きのカテゴリー出力方を記載した ▼ 今回は、カテゴリーをクリックした時に、 左側にサムネイル画像 右側に抜粋記事 丸みを帯びた長方形で囲む といったデザインにする方法をメモっておく。 扱うのは、下記３つ。 content-excerpt.php function-php css 左側にサムネイル画像を挿入 content-excerpt.phpの子テーマを作っておく （Xserve […]
TDP43はAβのフィブリル化を阻害して、AD病理を増悪させる
TAR DNA-binding protein 43 (TDP-43) は、筋萎縮性側索硬化症 (amyotrophic lateral sclerosis, ALS) や前頭側頭葉変性症（Frontotemporal lobar degeneration, FTLD）内に見られる凝集蛋白として同定されました [1] が、 その後、高齢者の脳内に凝集体として高率に存在することが明らかとなり、それら […]
ラットの髄液採取
私は以前、ラットの髄液を採取してエクソソームのプロテオーム解析を行っていた事がありました。 先日、大学院生時代の先輩から、 「マーモセットの連続髄液採取を考えているのだけれど、 情報量が少ないからラットの情報を参考にさせてほしい。」 という内容のメールが届きました。 以前のノートを引っ張りだし、文献を再検索して質問にお答えしたのですが、 またしばらくすると忘れそうなので […]
パンくずリスト（プラグイン）
プラグインでパンくずリストを追加する。 使用しているのは、「Breadcrumb NavXT」というプラグイン。 Breadcrumb NavXTの使い方 １．Breadcrumb NavXTのインストール 1-1. 管理画面 → プラグイン → 新規追加 → Breadcrumb NavXtで検索 1-2. インストール → 有効化 2. Breadcrub NavX […]
カスタムフィールドを使ってnoindexとnofollowを設定
私は今まで、「All in One SEO」というプラグインで個別の noindex と nofollow 属性の設定を行っていたのですが、 プラグインをアップデートしたら、「AIOSEO」に刷新され、 個別記事の「noindex」と「nofollow」を選択する項目が見当たらなくなってしまいました。 「困ったなー」と思って調べると、 WordPress の既存の機能で noinde […]
脳動脈瘤のリスク遺伝子
世界人口の3％の人達は、脳血管に動脈瘤を持つと言われています [1]。 未破裂動脈瘤の多くはサイズが3-4mm以下と非常に小さく、このような動脈瘤が破裂することは非常に稀（0-0.4％）と言われています [2]。 しかしながら、サイズが大きくなると破裂の危険性が高まり、破裂すると、くも膜下出血の原因となります。 くも膜下出血は、生命に関わり、命が助かった場合でも重い後遺症が残ることがあり、社会復帰 […]
【RStudio】デフォルトの作業ディレクトリを変更
デフォルトの作業ディレクトリは、最初は上の階層に設置されている。 この作業ディレクトリの初期設定を、任意の場所に変更したい場合の覚え書き。 ついでに、現在の作業ディレクトリの場所の確認方法と、その場所を変更する方法も紹介。 デフォルトのディレクトリを変更する方法 1. RStudioを開く 2. Tools -> Global options 3. “Default workin […]
Google Adsenseの利用停止処分：アドセンス狩り
ある日、Google AdSenseを開いたら、 “Your account is temporarily suspended – as a result of this suspension, ad serving is disabled.” （あなたのサイト、停止しました。） という掲示がされていて、驚きました。 Account Policy Center […]
AIMP2はαシヌクレイン凝集を促進する
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関連コンテンツユニットの利用
Google Adsenseの関連コンテンツユニットとは、Goggleが提供する機能レコメンド機能の事です。 ページに関連コンテンツユニットを設置すると、 Googleが関連したページをイメージ付で紹介してくれ、その間に関連広告が挿入される形になります。 この機能を利用すると、 Googleが提供する高性能なレコメンド機能が無料で利用できる ネイティブ広告としてコンテンツに馴染む形で […]
歯状回アストロサイトに蓄積したタウの、ニューロンへの影響
タウオパチーに分類される神経変性疾患 アルツハイマー病（Alzheimer’s disease, AD） 進行性核上性麻痺（Progressive supranuclear palsy, PSP) 大脳皮質基底核変性症（Corticobasal degeneration, CBD） 球状グリア性タウオパチー（globular glial tauopathy, GGT） 前頭側頭葉変性症 […]
【Photoshop】で画像に枠線をつける
私は今まで、スクショの画像の枠線は別のソフトを使用していたのですが、実はphotoshopで簡単に作製できる事を知りました。 スクショ画像に枠線を描く方法 1. やや広めにスクショ（Win + Shit + S） 2. photoshop -> 新規作成（Ctrl + N）-> 貼り付け（Ctrl + V） 3. 選択ツールを選ぶ（長方形ツールや切り抜きツールではない） 4. 画像いっ […]
【VS Code】2つのファイルを比較
VS Code で、2つのファイルを比較し、差分をハイライトする方法 ↓ 差分表示 (diff) 1. 最初に、比較したいファイルを VS Code で開いておく 2. 「Ctrl + P (or 表示 → Command Palette…）」 3. 入力欄に、「compare」と入力して、「Compare Active File With…」を選択 （「Compare A […]
中年期の拡張期高血圧は晩年の脳白質障害に影響する
高血圧は、脳心血管系に重大なダメージを与えることは言う前でもありませんが、高血圧自体に症状はなく、 急性期高血圧でなければ、脳心血管系の破綻→重篤な疾患（脳卒中や心筋梗塞 etc.）となるまでには数十年の経過がかかるので、 「気にはなるけれども……」 と言いながら放置してしまう人もいるようです。 血圧には、収縮期血圧と拡張期血圧とありますが、 「血圧○○mmHg以上」というときには、 […]
ある記事のno indexを解除してから元に戻るまで
私は、メインドメインとサブドメインの２個のサイトを作っていて、過去記事にいくつか重複するものがあったので、片方にnoindexを設定していました。 そしてある日、Google Search Consoleから知らせが届きます。 Coverage issue: Error Submitted URL marked ‘noindex’ みると、ある重複記事でnoindexに […]
毎日のちょっとした身体的活動で心が健康になる
運動が、身体だけでなく、脳機能や精神の健康維持にも欠かせないのは周知の事実ですが、実際、どれくらいの運動で効果があるのでしょうか？ ドイツ・ハイゼンベルグ大学のDr. Meyer-Lindenbergらの研究グループは、毎日の歩行や階段昇降など、ちょっとした身体的活動だけで、精神状態がよくなる事を、報告しました [1]。 毎日のちょっとした身体的活動で心が健康になる 著者らは、18–28歳の参加者 […]
【VSCode】リアルタイムプレビュー：CSSを反映させる方法も
VSCodeでHTMLのリアルプレビューを可能にする拡張機能 「HTML Preview」 がとても便利だと思ったので、備忘録。 HTML Previewの大まかな使い方 1. Ctrl + Shift + x (Extensions) -> HTML Previewを検索し、インストール 2. 一度htmlファイルを保存（保存していないとプレビュー表示されない） […]
アデュカヌマブの効果はずっと続く？
先月６日に行われたFDAのアデュカヌマブミーティングではだいぶ旗色が悪く、FDA承認は難しそうな印象ですが、 少なくともマウス脳内では成績優秀のようです。 今回、ドイツ・Tübingen大学のDr. Juckerらの研究グループは、アミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）プラークができる初期の段階からアデュカヌマブを接種すると、 晩年のAβプラーク病理形成が抑えられる、という内容を報告しま […]
【RStudio】テーマを変更
RStudioの画面は、デフォルトでは白いバックグラウンドになっている これを、私の好きなDark colorに変更する方法 1. Tools -> Global Options -> Appearance 2. 設定を変更 RStudio theme: Modern ZoomL 100% Editor font: Lucida Console Editor font s […]
GGA3欠損でBACE1が軸索内に蓄積する
GGA3は、Golgi-localized, gamma adaptin ear-containing, ARF-binding (GGA) ファミリーの一つで、トランス・ゴルジネットワーク–リソソーム間や、エンドソーム–リソソーム間のタンパク輸送等に重要な役割を果たすタンパクとして知られています。 アメリカ・タフツ大学のDr. Tescoらの研究グループは、以前、 マウスの神経細胞でGga3を欠 […]
フロントページを固定記事にし、カテゴリー別で新着記事一覧：WP Show Posts
以前、固定ページに新着記事一覧を載せるプラグインとして、「List Category Posts」を紹介したが（こちら）、このサイトでは別のプラグインに乗り換えたので、そちらを紹介。 現在、このサイトで使用しているのは「WP Show Posts」というプラグイン。 Show Postsの設定 プラグインをインストール → 有効化 管理画面 → WP Show Posts → リストを新規作成 投 […]
【ImageJ/Fiji】マクロ作成
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Macroの作成 Plugins→Macros→Recordを選択し、その状態で上記プログラムを実行していく。 Recorderの中のCreateを押す。 ijm画面が出てくるので、必要があれば編集し、File→Save asを選択する。 ファイル名.txtで、app→Plugins→ […]
食道のレヴィ病理はLBDの進行と相関が高い
パーキンソン病（Parkinson’s disease, PD） 認知症を伴うパーキンソン病（Parkinson’s disease dementia, PDD） レヴィ（Lewy）小体型認知症（Dementia with Lewy bodies, DLB） などは、 αシヌクレイン（α-synuclein, α-syn）の凝集を主成分とした、 Lewy小体（Lewy bo […]
複数行やタグを一括で置換：Search Regex
以前、全記事に手動で貼っていたGoogle Adsenseのコードを、プラグインを使った挿入に切り替えたのですが、 その時、今まで貼っていた「複数行」のコードを一括で置換・削除する必要があったので、その時行った方法を記録しておきます。 文字の置換については、以前「Better Search Console」というプラグインを紹介しました。 …が、こちらは複数行の置換・削除には対応して […]
【Ad Inserterで簡単に広告表示管理】Googleアドセンスの挿入 (AMP／関連コンテンツ)、特定の記事下に関連記事リストを挿入する方法も
私は最初の頃、Googleアドセンスの広告は記事に直接貼り付けていました。 理由は、Google AdSenseの自動広告を利用すると、必要以上に広告挿入部位が多くなってしまったり、意図しない部位に挿入されたりと、ちょっと使い勝手が悪かったからです。 一応、「ここにはやめてね。」と10箇所までは指定できるのですが、「これ以上はムリ」と拒否られ、 「記事の量とかに合わせて自分でカスタマイズしたほうが […]
COVID19に最も感染しやすい場所はどこ？
COVID19のワクチンの中間報告で盛り上がりをみせるアメリカですが、新規感染者数はうなぎのぼり。 マスク・隔離・長期間の我慢が苦手な人達は、 「もう無理！」 と、公共の場に集まって食事したり遊んだりしています。 また、経済的に困窮してなんとか働こうとする人達もいるので、 クラスターが追えないくらいに、再び感染が広がっています。 今回、アメリカ・スタンフォード大学のDr. Lesko […]
妊娠中のストレスは胎児の脳の発達に影響する
「妊娠中に過度のストレスにさらされると、お腹の赤ちゃんの発育に良くない」 と、よく言われますが…… イギリス・エジンバラ大学のDr. Boardmanらの研究グループは、妊娠中のお母さんのストレスと子供の脳の発育について科学的に検証しました [1]。 妊娠中のストレスは胎児の脳の発達に影響する 著者らは、７８組の母子を対象に、 母親の妊娠中の毛髪に含まれるコルチゾールの量（hair cortiso […]
Rinkerで商品管理
商品管理は「Rinker」か「カエレバ」が使いやすいと聞き、 検討の末、「Rinker」を導入することに。 以下、使い方▼ プラグインのインストール 公式サイトから「Rinker」のダウンロード（無料） アカウントを持っていない場合は、pisiv IDを作成 ZIPファイルのままWordPressのプラグインへアップロード プラグイン＞新規追加＞プラグインのアップロード ZIPファイルを選択し、 […]
αシヌクレイン凝集形成の多様性について真面目に検証
αシヌクレイン（α-synuclein, α-syn）は、パーキンソン病、レビィ小体型認知症、多系統萎縮症など、シヌクレイノパチーの主要病理タンパクとして研究が進められており、 α-syn凝集体の多様性が疾患や病理の多様性を生んでいる、という考えが主流となっています。 α-synは、タウetc.と違って、ただ振盪させているだけでモノマーが勝手に凝集していくのですが、 今までは、その時のバッファーの […]
タグを一括編集
新しいタグを、そのキーワードを踏む投稿全てに一括で追加したい場合。 1. 追加したいタグの名称で検索 1-1. 投稿＞投稿一覧＞検索 1-2. もし、全ての検索結果が１ページに表示されない場合は、右上の「表示オプション」タブを押し、ページごとに表示する項目数を検索結果数に変更して再度検索。 2. リストした投稿を一括編集 2-1. タイトル横のチェックボタンをクリックして、全選択。 2-2. 一括 […]
ADリスク遺伝子多型を持つ人は若い頃から海馬が小さくなる
アルツハイマー病（Alzheimer’s disease, AD）には、これまで多くのリスク遺伝子が報告されており、特にAPOE4は最も強力なリスク多型と言われています。 ADのリスク遺伝子ランキング（Alzform/TopResults.asp [1] より） # Gene Polymorphism Ethnicity OR (95% CI) P-value 1 APOE APOE_ […]
【ImageJ/Fiji】Colocalization算出（Striatum, spine markers）
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Colocalization Assay 1. Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。 2. Rectangleで、vesselsやStriosomesをよけるように選択し、 Image → Crop → Save as → T […]
画像の遅延読み込み（Lazy Load）
地道にサイトの高速化実施中。 今回取り組んだのは、画像の遅延読み込み「Lazy Load」。 プラグインで。 Lazy Loadのプラグインは色々あるが、今回は 有効インストール数が多い 更新頻度が高い 現在使用中のSPバージョンと相互性がある 他サイトでの評価が高い 等の理由から、「Smush」というプラグインを導入した。 このプラグインは、全ての画像の圧縮＆最適化と遅延読み込みが […]
ヒトの野生型APP遺伝子ノックインマウス
アルツハイマー病（Alzheimer’s disease, AD）の２大病理タンパクであるアミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）と過リン酸化タウ。 アミロイド仮説の提唱とともに、多くの変異アミロイド前駆体蛋白質（Amyloid precursor protein, APP）やプレセニリン (Presenilin, PSEN) 遺伝子の過剰発現マウスが開発され、AD研究に重要な […]
【Rで作図】バイオリン・プロット（Violin plot）
データをグラフにするとき、 「これのデータは バイオリン プロット で表すのが最適。」 と思う時があります。 今回は、それを R で作るときの備忘録。 ggplot2 のインストール ggplot2 は、“The Grammer of Graphics” という体系に基づいて設計されたパッケージ。 Hadley Wickham氏が作成。 ggplot2の文法 グラフ = 座標 (ggplot) + […]