低複雑性ドメインのアミノ酸主鎖同士の水素結合が、特定のタンパクの液液相分離および凝集化に関与
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タンパク質は、通常、２０種類のアミノ酸がバランス良く含まれている事が多く、それらのタンパク質はAnfinsenのドグマに従い、特定の構造に折りたたまれます。 しかしながら、20%程度のタンパク質の中には、限られた種類のア […]
お金持ちの子の話が興味深かった件
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夏休み。 子供たちは大学近くのテニスキャンプに通っています。 私は、「新しいお友だちできた？」と彼らに聞いてみました。 すると長男からは、 「うん。去年もキャンプに来てたんだけど、最近Nとよく話していて、実 […]
アメリカと日本の教育方針の違いに思う事
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少し前の話。 職場の同僚と院内のカフェでコーヒーを飲んでいました。 私の帰国の日程が本格的に決まり、私も彼女も残りの時間を名残惜しんでいます。 ・ ・ ・ 「で、近い将来にアメリカに戻ってくる […]
【Rトラブルシュート】csvで書き出すとき遭遇したトラブル
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あるコードをcsvで書き出し、 # CSV で書き出し write.csv(Data, "file_name.csv", row.names = FALSE) それを別アプリで開こうとすると、下記エラーメッセージが出現し […]
タウの “マスター” リン酸化部位
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Alzheimer's disease（AD）の主要病理の一つ、過リン酸化タウ。 タウには、リン酸化、ユビキチン火、アセチル化、メチル化、SUMO化、糖化……と、様々な翻訳後修飾（post-translational m […]
Funny Money Company（ファニー・マニー・カンパニー）
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去年に引き続き、夏休み中、３人とも職場近くのテニスクラブに通っています。 キャンプにはいつも車で向かうのですが、今回はその道中での一コマ。 高速道路を走行中、テニス場が近づいてくると、「FMC」の赤い文字が […]
【Rトラブルシュート】the condition has length > 1 and only the first element will be used
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R で if 構文を使うときに時々遭遇する下記エラーメッセージ。 the condition has length > 1 and only the first element will be used 例えば、下 […]
アンダーライン色々：通常下線、太め、マーカー風、波線、２重線
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文字に下線を引く際の色々。 普通の下線: <u> 普通の下線だったら <u> で。 <u>下線を引きます</u> output 下線を引きます 下線のバリエーション①: b […]
独立記念日（Independence Day）2022
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７月４日は、アメリカ独立記念日（Independence Day）でした。 毎年、たくさんのイベントが開催されており、私達の住む町の公園でも、日中はカーニバル、夜は花火といった大きなイベントがあります。 花火はだいたい夜 […]
【Rで統計】カイ二乗検定
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カイ二乗検定とは カイχ二乗検定というと、一般にピアソンのカイ二乗検定を指す事が多い。 仮説によって、適合度検定や独立性の検定などがある。 基本はｔ検定と似ているけれど、ｔ検定が「２つの群の連続変数（numerical […]
“細胞外” のAβプラークの起源は “細胞内” のオートリソソームだった
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「オートファジー」は、生態系の恒常性を維持する為になくてはならないものであり、アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）を含む数々の変性疾患でオートファジー機能障害との関連性が示唆されています [ […]
【Rトラブルシュート】openBinaryFile: permission denied (Permission denied)
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前回、"openBinaryFile: invalid argument" の問題は絶対パスを指定することで解消したけど、 次に出てきたエラーメッセージは、 openBinaryFile: permission deni […]
【Rの設定】基本言語を変更
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この間、R と RStudio でバグが起こって全インストールし直したら、エラーメッセージが日本語に変わっていた。 どうやら、再インストールする時に疲れていて言語選択をスキップしてたみたい……。 別に日本語 […]
【トラブルシュート】package or namespace load failed for ‘tidyverse’ in loadNamespace と Error in app$vspace(new_style$`margin-top` %||% 0) : attempt to apply non-function
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ある日、Rを使っていて、突然 "tidyverse" が使えなくなった。 Error: package or namespace load failed for ‘tidyverse’ in loadNamespace […]
【Rデータ整理】クロス集計表
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カテゴリデータの集計表⇔データフレームの切り替え。 クロス集計表 例えば、 運動あり 運動なし 認知症あり 10 15 認知症なし 20 5 のようなデータの集計表を作る時。 基本は行列で作る。 行列（matrix）で作 […]
大谷翔平選手を見にスタジアムへ
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先日の JUNE JAM で久しぶりに会った日本人のお友達から 「今、大谷翔平が Philly に来てるらしいよ。」 と教えてもらいました。 「え、ホント!? 試合見てみたいな。」 私は普段あまり野球の試合 […]
【Rトラブルシュート】 attempt to set ‘colnames’ on an object with less than two dimensions
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列名を変更しようとして colnames() を使った時に下記エラーメッセージ。 attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions […]
バンド＆オーケストラコンサート
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長男（１１歳）は、4th Grade の時から音楽の授業でバンドを選択していました。 COVID-19のパンデミック中は、対面の授業がなかったので家でもほとんど練習していませんでしたが、対面授業が再開してからは、音楽のバ […]
【RStudio】RStudio Cloud を使う
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私は、自宅PCと職場PCの２箇所でRStudioを利用していますが、時々データをクラウドに上げ忘れたりして困る事があります。 リモート接続で自宅PC⇔職場PCに入り、リモートでデータをクラウドに上げる、という方法で対処し […]
初報酬でプレゼントを
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ある日の事、長男（１１歳）が家の中ごごそごそと物色し始めました。 私「何をしているの？」 と尋ねると、 長男「何か ebay で売れるものはないかと思って。」 とのこと。 その後彼は、子供部屋にあった Knock Hoc […]
【Rトラブルシュート】Error in seq_len(n) : argument must be coercible to non-negative integer
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今までサクサク動いていたコードで、カラーコードだけ変更したつもりでRUNしたら、最後にグラフを ggsave で保存する時に下記メッセージ↓。 Error in seq_len(n) : argument must be […]
【Rデータ整理】tidy data に変換する
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↑ これは見やすいけど、Rで計算する場合は tidy data じゃないのでちょっと困る。 これを、Rに取り込んで、tidy data に変換する方法。 tidy data と messy data については、多くのサ […]
