【Excel】数式を列全体に一括で適応
普段からオートフィルにはお世話になっているけど、100セル以上とかオートフィルするのは、地味に時間がかかる。 ので、数式を列全体（とか長いセルとか）に一瞬でオートフィルする方法↓ 数式を列全体に一括で適応 方法１：数式を […]
【Rで作図】グラフタイトル、x軸、y軸、レジェンドタイトルを変更する
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下記の様に棒グラフを作成。 # bar graphs Data$Group <- factor(Data$Group, levels=c("WTM", "PdM" , "WTF" , "PdF" )) Data$R […]
【Excelマクロ/VBA】Personal Macro Workbook in Startup Folder must stay open for recording
マクロを登録しようとしていたら、下記表示が出て先に進めなくなった。 Personal Macro Workbook in Startup Folder must stay open for recording ……ちょっ […]
進行の早いアルツハイマー病のタウの構造の違いを間接的に検証
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）は、認知症をきたす疾患の中で最も症例の多い疾患ですが、同じADでも、10年以上かけてゆっくり進行するタイプもあれば、発症から数ヶ月～1年程度で急激に症状が […]
【Rデータ整理】列の順番を並び替える：select
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データフレームの列の順番を並び替える時は、列選択で使用する dplyr::select を使う。 例えば、下記の様なデータフレーム（データ名: Dat1）があって、 これを左から 「Sex -> Genotype […]
【ファイルエクスプローラー】拡張子を表示
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普段隠れているファイルの拡張子。 時々表示させて確認したり、拡張子を変更したりしたい。 ……そんな時には、 ファイルエクスプローラーの「表示」タブ→「表示／非表示」にある「ファイル名拡張子」にチェックを入れ […]
Aβ38が多いと認知機能低下がマイルド
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アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) の主要病理の1つ、アミロイドβ (Amyloid beta, Aβ) 。 Aβは、アミロイド前駆蛋白 (Amyloid precursor prote […]
【Rで作図】ggplot の基本概念
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ggplot (ggplot2) では色々なグラフがかけるけど、基本概念は「レイヤー構造」で作る、という事。 イメージは photoshop や illustrator のレイヤーと似てる。 ggplot( […]
【Excel】01, 001…という形で記入する方法
エクセルで、「01」と記入しても、自動的に「1」と変換されて困る事がある。 特に、ID番号とか付けたい場合は、順番がずれないように「01」とか「001」にしたい。 この場合は、「書式設定」を変更する。 01, 001.. […]
Aβがp181タウとp217タウを誘導する
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アルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）の２大病理といえば「アミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）」と「タウ」ですが、 この２つの病理はどちらが先か、という議論は以前から続いていました […]
【Rデータ整理】ちょっとした集計：dplyr::summarise
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データフレーム内の合計や平均値などを求める時、Rでは「aggregate関数」が用意されているけど、比較的作業時間がかかるため、「dplyr::summarise」の方が良さげ。 ちょっとした集計：dplyr::summ […]
【Excel】セルをドラッグできなくなったら……
ある時期から、自宅PCのエクセルでセルのドラッグができなくなった。 オートフィルとか、ページセクションとか、トラックボールでできなくって結構不便……。 で、知らべたら解決方法が。 セルをドラッグできるようにする設定方法 […]
加齢による炎症増加のメカニズムに核ラミナの減少が関与
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加齢による慢性炎症は、アルツハイマー病やパーキンソン病などの神経変性疾患と密接に関係しており、 炎症がこれら変性疾患の二次的変化だけでなく、増悪因子として働く事は周知の事実だと思います。 でも、どうして歳をとると慢性炎症 […]
【Rデータ整理】文字を切り出して新しい列に追加する：mutate／substr／str_sub
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文字列から一部だけ切り出して、新しい列を作りたい時。 列の追加は dplyrパッケージ: mutate 文字の切り出しは R標準パッケージ: substr or substring stringrパッケージ: st […]
【Excel】セルの装飾で、違うセルの値を参照する方法
幾つかの遺伝子改変マウスを管理するときに、セルを色分けしているとわかりやすい。 ただこの場合、例えばバイジェニックだと２個のセル（DFとDG）を参照して別セル（DD）をハイライトする事になる。 今回はその方法の備忘録。 […]
2022年 注目の臨床試験（Nature Medicine）
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2022年、医療科学界で注目されている臨床試験について、Nature Medicine が各領域のリーダー達にインタビューしています。 感染症から変性疾患まで、11の臨床試験がピックアップされました。 2022年に注目す […]
【Excel】オートフィル etc. のショートカット
マウス（動物の方）の管理をExcelで行っているけど、私は基本マウス（PCの方）操作が嫌いなので、キーボードのショートカットを多用している。 前回は相対参照⇔絶対参照のショートカットキー「F4」を書き留めたので、今回は次 […]
2022年 注目の科学（Nature）
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新年を迎えました。 2022年、サイエンス界でどのようなイベントが注目されているのでしょうか？ 今回は、Nature誌の ”2022年に注目すべきサイエンスイベント” からの情報。 今年注目されている領域は、コロナウイル […]
2021年 今年のブレイクスルー研究（Science）
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年の瀬、各誌この１年のブレイクスルーや来年の展望etc.をまとめています。 今回は、Science誌の ”2021 Breakthrough of the Year” から。 2021 BREAKTHROUGH OF T […]
Windows 11で表示されるようになったタスクバーの余計なアイコンを非表示
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先日 Windows 11 にアップグレードしてから IME でちょっとイラッときたので、この機会にタスクバーに追加された余計なアイコンも削除した。 アップグレードによってタスクバーに追加されたアイコンは下記5点（Edg […]
2021年 Nature選出サイエンスニュース（Nature）
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年の瀬、各誌この１年のブレイクスルーや来年の展望etc.をまとめています。 今回は、Nature誌の ”The science news that shaped 2021: Nature’s picks” から。 202 […]
Windows11: 日本語IMEの削除
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先日 Windows11 にアップグレードしてから、日本語IMEも再インストールされていた。 私は Google Japanese Input の方が断然好きで、日本語IMEは要らない……。 どころか、英語との切り替え時 […]
運動すると血漿中のクラステリンによって脳の炎症が抑えられ、認知機能がUPする
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運動の認知機能等に対する効果については、このブログでも何度かとりあげてきました。 運動がアルツハイマー病（Alzheimer's disease, AD）などの変性疾患病理を抑えたり神経新生を促したりして、認知機能を保つ […]
【RStudio】environment 内のオブジェクトを一掃する
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RStudioでは、実行したオブジェクト（ベクトル、リスト、データフレームなど）はそのまま "environment" の中に残り、再利用することができる。 Emvironment に残っているオブジェクトの確認方法 こ […]
【Excel】数式の相対参照⇔絶対参照を切り替えるショートカット：F4
エクセルを使っている人達ならほぼほぼみんなお世話になっているであろう「相対参照」と「絶対参照」。 相対参照、絶対参照とは 通常、関数をコピペしたりオートフィルしたりすると、そのセルの場所から移動した分だけ自動的に計算して […]
【Rで統計】Kruskal.Wallis検定
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前回、ノンパラメトリックの2群検定の方法を書き留めておいたけど、 「よく考えたら、2群じゃなくて、2群ｘ3群の6群でみなきゃじゃん。」 とゆーことに気づき、 多重比較のデータを追加した。 各グループが正規分布じゃないこと […]
記憶の固定化には2日目の睡眠も大事みたい
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私が大学生の頃、よく一夜漬けで勉強し、後から後悔していました。 テスト初日はなんとかなっても、2日目、3日目となるとそうはいかない…… 後に「記憶の固定にはその日の睡眠が重要」ということを知り、「やっぱりなー」と腑に落ち […]
【Excel】頭文字や後ろの文字など、任意の文字を抽出
エクセルでマウスの管理をしているけど、マウスIDとは別に、実験用のID "experimental ID" を付けたい。 例えば、野生型マウス（WT）でオス（M）でSham手術（S）でインジェクションマテリアルがAD-t […]
【Rで統計】Wilcoxonの順位和検定
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あるデータのリバイスで、患者さんが最後に認知機能検査を受けた時期から亡くなるまでの期間が解析グループで差があるんじゃないか、とレビューアーから指摘された。 なので、その期間が各群で差がないことを示す検定結果をつける事に。 […]
グリアを神経に変えて病気を治す…という論文には間違いがあったらしいーその２
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先日、「アデノ随伴ウイルスベクターを使ってNeuroD1を過剰発現させ、アストロサイトをニューロンに形質転換する」という論文の間違いについて取り上げましたが [1]、 今回は「レンチウイルスで同じNeuroD1を過剰発現 […]
【Rで作図】ヒストグラム
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あるデータのリバイスで、患者さんが最後に認知機能検査を受けた時期から亡くなるまでの期間が解析グループで差があるんじゃないか、とレビューアーから指摘された。 なので、その期間が各群で差がないことを示す検定結果をつける事に。 […]
ミクログリアはAβの伝播にも関与する？
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先日、ミクログリアがタウの伝播に一役買っているかも…という内容の論文 [1] を紹介しましたが、 今回はアミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）の話。 ドイツ・Freiburg大学の Dr. Meyer-Lueh […]
【Excel】大文字、小文字、先頭のみ大文字
エクセルには、ワードに備えられている 「大文字、小文字、先頭のみ大文字 etc.」 を選択するボタンやショートカットがない。 ではどうするかというと、関数を使う。 大文字に変換：UPPER 関数 例えば、A […]
タウ＋ニューロンを貪食したミクログリアは、お腹いっぱいになるとそれを吐き出してタウ伝播に一役買ってしまう……
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脳のお掃除屋さんのミクログリア。 アミロイドβ（Amyloid beta, Aβ）とかタウとか、脳内で蓄積すると困るタンパク達を貪食して除去しようとしてくれていますが、反面、活性化したミクログリアが炎症性サイトカインを出 […]
【Rデータ整理】列の追加：mutate
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Rで列を追加する時は、 dplyr::mutate() を使っている。 mutate(列A+列B) のように計算式の結果を入れられるので便利だけど、文字列を入れる時はこんな感じ ▼ 例：Data というデータフレーム内で […]