ラットの髄液採取
私は以前、ラットの髄液を採取してエクソソームのプロテオーム解析を行っていた事がありました。 先日、大学院生時代の先輩から、 「マーモセットの連続髄液採取を考えているのだけれど、 情報量が少ないからラットの情報を参考にさせてほしい。」 という内容のメールが届きました。 以前のノートを引っ張りだし、文献を再検索して質問にお答えしたのですが、 またしばらくすると忘れそうなので […]
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備忘録
パンくずリスト（プラグイン）
プラグインでパンくずリストを追加する。 使用しているのは、「Breadcrumb NavXT」というプラグイン。 Breadcrumb NavXTの使い方 １．Breadcrumb NavXTのインストール 1-1. 管理画面 → プラグイン → 新規追加 → Breadcrumb NavXtで検索 1-2. インストール → 有効化 2. Breadcrub NavX […]
カスタムフィールドを使ってnoindexとnofollowを設定
私は今まで、「All in One SEO」というプラグインで個別の noindex と nofollow 属性の設定を行っていたのですが、 プラグインをアップデートしたら、「AIOSEO」に刷新され、 個別記事の「noindex」と「nofollow」を選択する項目が見当たらなくなってしまいました。 「困ったなー」と思って調べると、 WordPress の既存の機能で noinde […]
【RStudio】デフォルトの作業ディレクトリを変更
デフォルトの作業ディレクトリは、最初は上の階層に設置されている。 この作業ディレクトリの初期設定を、任意の場所に変更したい場合の覚え書き。 ついでに、現在の作業ディレクトリの場所の確認方法と、その場所を変更する方法も紹介。 デフォルトのディレクトリを変更する方法 1. RStudioを開く 2. Tools -> Global options 3. “Default workin […]
Google Adsenseの利用停止処分：アドセンス狩り
ある日、Google AdSenseを開いたら、 “Your account is temporarily suspended – as a result of this suspension, ad serving is disabled.” （あなたのサイト、停止しました。） という掲示がされていて、驚きました。 Account Policy Center […]
関連コンテンツユニットの利用
Google Adsenseの関連コンテンツユニットとは、Goggleが提供する機能レコメンド機能の事です。 ページに関連コンテンツユニットを設置すると、 Googleが関連したページをイメージ付で紹介してくれ、その間に関連広告が挿入される形になります。 この機能を利用すると、 Googleが提供する高性能なレコメンド機能が無料で利用できる ネイティブ広告としてコンテンツに馴染む形で […]
【Photoshop】で画像に枠線をつける
私は今まで、スクショの画像の枠線は別のソフトを使用していたのですが、実はphotoshopで簡単に作製できる事を知りました。 スクショ画像に枠線を描く方法 1. やや広めにスクショ（Win + Shit + S） 2. photoshop -> 新規作成（Ctrl + N）-> 貼り付け（Ctrl + V） 3. 選択ツールを選ぶ（長方形ツールや切り抜きツールではない） 4. 画像いっ […]
【VS Code】2つのファイルを比較
VS Code で、2つのファイルを比較し、差分をハイライトする方法 ↓ 差分表示 (diff) 1. 最初に、比較したいファイルを VS Code で開いておく 2. 「Ctrl + P (or 表示 → Command Palette…）」 3. 入力欄に、「compare」と入力して、「Compare Active File With…」を選択 （「Compare A […]
ある記事のno indexを解除してから元に戻るまで
私は、メインドメインとサブドメインの２個のサイトを作っていて、過去記事にいくつか重複するものがあったので、片方にnoindexを設定していました。 そしてある日、Google Search Consoleから知らせが届きます。 Coverage issue: Error Submitted URL marked ‘noindex’ みると、ある重複記事でnoindexに […]
【VSCode】リアルタイムプレビュー：CSSを反映させる方法も
VSCodeでHTMLのリアルプレビューを可能にする拡張機能 「HTML Preview」 がとても便利だと思ったので、備忘録。 HTML Previewの大まかな使い方 1. Ctrl + Shift + x (Extensions) -> HTML Previewを検索し、インストール 2. 一度htmlファイルを保存（保存していないとプレビュー表示されない） […]
【RStudio】テーマを変更
RStudioの画面は、デフォルトでは白いバックグラウンドになっている これを、私の好きなDark colorに変更する方法 1. Tools -> Global Options -> Appearance 2. 設定を変更 RStudio theme: Modern ZoomL 100% Editor font: Lucida Console Editor font s […]
フロントページを固定記事にし、カテゴリー別で新着記事一覧：WP Show Posts
以前、固定ページに新着記事一覧を載せるプラグインとして、「List Category Posts」を紹介したが（こちら）、このサイトでは別のプラグインに乗り換えたので、そちらを紹介。 現在、このサイトで使用しているのは「WP Show Posts」というプラグイン。 Show Postsの設定 プラグインをインストール → 有効化 管理画面 → WP Show Posts → リストを新規作成 投 […]
【ImageJ/Fiji】マクロ作成
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Macroの作成 Plugins→Macros→Recordを選択し、その状態で上記プログラムを実行していく。 Recorderの中のCreateを押す。 ijm画面が出てくるので、必要があれば編集し、File→Save asを選択する。 ファイル名.txtで、app→Plugins→ […]
複数行やタグを一括で置換：Search Regex
以前、全記事に手動で貼っていたGoogle Adsenseのコードを、プラグインを使った挿入に切り替えたのですが、 その時、今まで貼っていた「複数行」のコードを一括で置換・削除する必要があったので、その時行った方法を記録しておきます。 文字の置換については、以前「Better Search Console」というプラグインを紹介しました。 …が、こちらは複数行の置換・削除には対応して […]
【Ad Inserterで簡単に広告表示管理】Googleアドセンスの挿入 (AMP／関連コンテンツ)、特定の記事下に関連記事リストを挿入する方法も
私は最初の頃、Googleアドセンスの広告は記事に直接貼り付けていました。 理由は、Google AdSenseの自動広告を利用すると、必要以上に広告挿入部位が多くなってしまったり、意図しない部位に挿入されたりと、ちょっと使い勝手が悪かったからです。 一応、「ここにはやめてね。」と10箇所までは指定できるのですが、「これ以上はムリ」と拒否られ、 「記事の量とかに合わせて自分でカスタマイズしたほうが […]
Rinkerで商品管理
商品管理は「Rinker」か「カエレバ」が使いやすいと聞き、 検討の末、「Rinker」を導入することに。 以下、使い方▼ プラグインのインストール 公式サイトから「Rinker」のダウンロード（無料） アカウントを持っていない場合は、pisiv IDを作成 ZIPファイルのままWordPressのプラグインへアップロード プラグイン＞新規追加＞プラグインのアップロード ZIPファイルを選択し、 […]
タグを一括編集
新しいタグを、そのキーワードを踏む投稿全てに一括で追加したい場合。 1. 追加したいタグの名称で検索 1-1. 投稿＞投稿一覧＞検索 1-2. もし、全ての検索結果が１ページに表示されない場合は、右上の「表示オプション」タブを押し、ページごとに表示する項目数を検索結果数に変更して再度検索。 2. リストした投稿を一括編集 2-1. タイトル横のチェックボタンをクリックして、全選択。 2-2. 一括 […]
【ImageJ/Fiji】Colocalization算出（Striatum, spine markers）
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Colocalization Assay 1. Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。 2. Rectangleで、vesselsやStriosomesをよけるように選択し、 Image → Crop → Save as → T […]
画像の遅延読み込み（Lazy Load）
地道にサイトの高速化実施中。 今回取り組んだのは、画像の遅延読み込み「Lazy Load」。 プラグインで。 Lazy Loadのプラグインは色々あるが、今回は 有効インストール数が多い 更新頻度が高い 現在使用中のSPバージョンと相互性がある 他サイトでの評価が高い 等の理由から、「Smush」というプラグインを導入した。 このプラグインは、全ての画像の圧縮＆最適化と遅延読み込みが […]
【Rで作図】バイオリン・プロット（Violin plot）
データをグラフにするとき、 「これのデータは バイオリン プロット で表すのが最適。」 と思う時があります。 今回は、それを R で作るときの備忘録。 ggplot2 のインストール ggplot2 は、“The Grammer of Graphics” という体系に基づいて設計されたパッケージ。 Hadley Wickham氏が作成。 ggplot2の文法 グラフ = 座標 (ggplot) + […]
WordPress記事内の文字を一括で置換する
蓄積した記事内の特定の文字を一括で置換したい… という時に便利なプラグイン 「Better Search Replace」 Better Search Replaceの使い方 1. インストール → 有効化 2. 管理画面 → ツール → Better Search Replace 3．各項目を選択し、プレビュー 3-1. Search for 検索したい文字列。 3-2. Replace wit […]
固定記事にウィジェットを表示（プラグインで）
使用したのは、「Page Builder by SiteOrigin」というプラグイン。 Page Builder by SiteOriginの使い方 1. インストール → 有効化 2. 投稿画面に「ページビルダー」というタブが現れるので、選択 3. 「列を追加」で、列の数、サイズをカスタマイズ可能 4. 「ウィジェットを追加」で、任意の列にウィジェットを入れていく 5. 「公開」 […]
投稿者名を非表示に
セキュリティー上、個人ブログの投稿者名は非表示にしておいた方が良い… という事で、今までは「Show and Hide Author」というプラグインを使っていましたが、プラグインなしでも簡単にできそうだったので、やってみました。 投稿記事の投稿者名を非表示に 1. 管理画面 → 外観 → テーマエディター 2. 投稿者名は、「function.php」の中で、下記のように設定されている。 fun […]
【ImageJ/Fiji】Striatum の Spine density のカウント
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Spine DensityのCount（cell countにも使える） Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。Color mode : Grayscaleにし、Split channelsの☑を外しておく。 Rectangleで、v […]
noindex / nofollow / sponsored / ugc …どうする？
SEO対策で noindex／nofollow／sponsored／ugc の設定をちゃんとした方がいい… ということで、 内容をまとめました。 そもそも私のブログは自分用の要素が強いので、 SEO対策は最重要項目ではないはずなのですが… ただ、ブログを書く上での方法を色々調べていると、 高頻度で「SEO対策」という言葉に出会います。 「やっぱり私も色々し […]
【Excel】外れ値の検定（Smirnov-Grubbsの棄却検定）
データの中に、一つだけ他のデータとかけ離れている値がある場合、それを外れ値として棄却するべきかどうか、検定する方法。 スミルノフ・グラブス棄却検定 帰無仮説：この値は外れ値ではない 対立仮説：この値は外れ値である 1. 検定統計量Tを求める エクセルの場合、 eg. A1:A10の中にあるデータ中、A5の値が外れ値かどうか検証したい場合 作業セル：= (A5-(average(A1:A10))/S […]
【ImageJ/Fiji】StriatumのSpineのIntensityの求め方
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Intensityの求め方 Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。Color mode : GrayscaleにしSplit channelsの☑を外しておく。 Rectangleで、vesselsやStriosomesをよけるように […]
【ImageJ/Fiji】Representative image作成
以前作成した、Image Jのプロトコール。 ※ Fijiのダウンロード：http://fiji.sc/Fiji Representative Imageの作り方 1. Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。 Split channelsに☑をいれておく。 2. Image → Color → Merge Channels 3. 見せたい色のとこ […]
【Excel】INDEX関数とMATCH関数を使って、任意のデータを抽出
違う時期に抽出したデータで、 各行の並びがバラバラになっている事がある。 「嗚呼、こっちのデータとあっちのデータを照合したい…」 という時に便利な関数。 例題 eg. 下記のようなDeta AとData Bがあるとする。 データA： A B C D 1 Data A data A-1 data A-2 data A-3 2 apple 21 32 21 3 orange 31 44 32 4 gr […]
【Rデータ整理】データフレームの最初の行、ディメンジョン、構造を確認する：head／dim／str
テーブルデータを取り込んだ後は、最初の6行、ディメンジョン、概要などを確認する。 データの取り込み 例えば、 コンソールに下記入力してデータを取り込む。 例えば、Dドライブにある”data.csv”というファイルを取り込む場合。 > data <- read.csv("D:/R/R directroy/data.csv", header=TRUE) 1行目はヘッ […]
【RStudio】Console内のオブジェクトを一掃する
コンソールがごちゃごちゃなって、内容を一掃したいときは、 右上の🧹マークをクリック。 ・ ・ ・ きれいになった。
【Excel】ピアソン相関係数（r値, t値, p値）
エクセルでピアソン相関係数を算出する方法 例題 eg. 下記のようなデータがあった場合 r value =PEARSON(データ1の範囲,データ2の範囲) =PEARSON(A2:A28,B2:B28) r = 0.62 という数値が返る t value t valueは、 =相関係数*SQRT(n数-2)/SQRT(1-相関係数^2) =E14*SQRT(27-2)/SQRT(1-E14^2) […]
【Excel】各セルの名前を一括で追加/削除
Data analysisから抽出したエクセルデータで、時々各セルの名前を一括変更したい時がある。 名前を削りたい時 例えば、 “D:\Slide Scanner\Scan-200825-BF-409-Hipp-FN-CPI\1986-089_409.mrxs” という名前がずらっと並んでいた場合、 “1986-089” という名前だけにしたい時。 […]
【Excel】オッズ比とP値
オッズ比とP値はエクセルで計算可。 X1 X2 Total Y1 a b a+b Y2 c d c+d Total a+c b+d a+b+c+d 上記のようなデータがあった場合、期待値は、 期待値 X1 X2 Total Y1 (a+c)*(a+b) /(a+b+c+d) (a+b)*(b+d) /(a+b+c+d) a+b Y2 (a+c)*(c+d) /(a+b+c+d) (b+d)*(c+ […]
【ImageJ/Fiji】スケールバーを表示
ImageJ/Fijiでスケールバーを表示する方法。 ……高性能の顕微鏡で撮影した画像には、たいていスケールの情報が入っているので、まずはそちらから。 スケール情報を表示 通常の場合 Fijiで画像を開く> Analyze > Tools > Scale bar… スケールバーの表示方法を設定（長さ、太さ、色、フォントetc.） Width in µm: 横方向のバ […]
OneDrive, Dropbox, Creative Cloudの保存先を別ドライブに移動
私は、ドキュメントファイル系はDドライブに入れるように設定していましたが、OneDriveやDropbox等のクラウドストレージの保存先をCドライブにしたままだったため、 Cドライブの容量が少ななくなってきました。 …ということで、今回、OneDrive、Dropbox、Creative Cloud の保存先を変更。 ディスクマネージャを開いて確認 1-1. Win + X → Disk Mana […]