【Rトラブルシュート】Error: attempt to use zero-length variable name
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R markdown のチャンクに ```{r fig.height=10 fig.width=6} コード色々 ``` と書いて、「Ctrl + Enter」で実行しようとしたら下記エラーが出た。 Error: att […]
「備忘録」の記事一覧
【Rで作図】グループ内でサブブループによってプロットの色と形を変える
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下記のようなグラフがあり、 これにプロットを重ねたい……でもただプロットするだけじゃなくて、各グループ内にいるオスとメスがプロットの形と色で区別できるようにしたい。 そんな場合の備忘録↓ グループ内でサブブループによ […]
【Rで作図】棒グラフにプロットを重ねる
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最近はどのジャーナルからも「棒グラフにはプロットを重ねるように」と言われると思う。 私自身、プロットしていないと気持ちが悪い。 で、その方法 ↓ 棒グラフにプロットを重ねる 棒グラフだけだと mean とかのデータを使う […]
【Rで作図】x軸ラベルを斜めにする
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下記グラフのx軸ラベルを斜めにしたい場合。 theme(axis.text.x = element_text(angle = 角度, hjust = 高さの調節)) を追加する。 theme(axis.text.x = […]
【Rで統計】F検定とt検定
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等分散の検定 データが等分散かどうか、F test で検証。 var.test(グループ1, グループ2) var.test(Tg$NFT, WT$NFT) アウトプットは下記↓ output F test […]
【Rトラブルシュート】Error in library(ggsignif) : there is no package called ‘ggsignif’
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パッケージ "ggsignif" をインストールしようとして、 install.packages(ggsignif) と入れて実行したら下記エラーメッセージ↓ Error in library(ggsignif) : t […]
【Excelマクロ／VBA】Can’t Execute Code in Break Mode
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家で作ったVBAをクラウドに上げて、職場で実行しようとした時に出てきたこの表示。 あれ？と思って調べた時の備忘録。 前置き：別の場所で作ったVBAの参照元を変更した まず、クラウドに上げておいたVBAは、自宅PCの保管場 […]
【Rで作図】x軸の順番を変更
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下記のようにグラフを作った。 # bar graphs factor(Data_NFT_sum$Region, levels=c("Ipsi-Hipp", "Ipsi-Ctx" , "Cont-Hipp" , "Cont […]
【Excelマクロ/VBA】マクロ実行ボタンの設置
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ボタンをポンっと押すだけで自動でマクロを実行できるようにしたい……という場合。 こんな感じでボタンを作っておくと便利 ↓ マクロ実行ボタンの設置 １．「開発」タブ → 「挿入」→ 「ボタンマーク」を選択。 […]
【Rで作図】エラーバーを追加する
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とある棒グラフを作成。 このグラフにエラーバーを付けたい場合、 geom_errorbar() を追加する。 エラーバーをつける 標準偏差（standard deviation, SD） SDは、 dplyr::summ […]
【Excel】数式を列全体に一括で適応
普段からオートフィルにはお世話になっているけど、100セル以上とかオートフィルするのは、地味に時間がかかる。 ので、数式を列全体（とか長いセルとか）に一瞬でオートフィルする方法↓ 数式を列全体に一括で適応 方法１：数式を […]
【Rで作図】グラフタイトル、x軸、y軸、レジェンドタイトルを変更する
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下記の様に棒グラフを作成。 # bar graphs Data$Group <- factor(Data$Group, levels=c("WTM", "PdM" , "WTF" , "PdF" )) Data$R […]
【Excelマクロ/VBA】Personal Macro Workbook in Startup Folder must stay open for recording
マクロを登録しようとしていたら、下記表示が出て先に進めなくなった。 Personal Macro Workbook in Startup Folder must stay open for recording ……ちょっ […]
【Rデータ整理】列の順番を並び替える：select
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データフレームの列の順番を並び替える時は、列選択で使用する dplyr::select を使う。 例えば、下記の様なデータフレーム（データ名: Dat1）があって、 これを左から 「Sex -> Genotype […]
【ファイルエクスプローラー】拡張子を表示
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普段隠れているファイルの拡張子。 時々表示させて確認したり、拡張子を変更したりしたい。 ……そんな時には、 ファイルエクスプローラーの「表示」タブ→「表示／非表示」にある「ファイル名拡張子」にチェックを入れ […]
【Rで作図】ggplot の基本概念
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ggplot (ggplot2) では色々なグラフがかけるけど、基本概念は「レイヤー構造」で作る、という事。 イメージは photoshop や illustrator のレイヤーと似てる。 ggplot( […]
【Excel】01, 001…という形で記入する方法
エクセルで、「01」と記入しても、自動的に「1」と変換されて困る事がある。 特に、ID番号とか付けたい場合は、順番がずれないように「01」とか「001」にしたい。 この場合は、「書式設定」を変更する。 01, 001.. […]
【Rデータ整理】ちょっとした集計：dplyr::summarise
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データフレーム内の合計や平均値などを求める時、Rでは「aggregate関数」が用意されているけど、比較的作業時間がかかるため、「dplyr::summarise」の方が良さげ。 ちょっとした集計：dplyr::summ […]
【Excel】セルをドラッグできなくなったら……
ある時期から、自宅PCのエクセルでセルのドラッグができなくなった。 オートフィルとか、ページセクションとか、トラックボールでできなくって結構不便……。 で、知らべたら解決方法が。 セルをドラッグできるようにする設定方法 […]
【Rデータ整理】文字を切り出して新しい列に追加する：mutate／substr／str_sub
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文字列から一部だけ切り出して、新しい列を作りたい時。 列の追加は dplyrパッケージ: mutate 文字の切り出しは R標準パッケージ: substr or substring stringrパッケージ: st […]
【Excel】セルの装飾で、違うセルの値を参照する方法
幾つかの遺伝子改変マウスを管理するときに、セルを色分けしているとわかりやすい。 ただこの場合、例えばバイジェニックだと２個のセル（DFとDG）を参照して別セル（DD）をハイライトする事になる。 今回はその方法の備忘録。 […]
【Excel】オートフィル etc. のショートカット
マウス（動物の方）の管理をExcelで行っているけど、私は基本マウス（PCの方）操作が嫌いなので、キーボードのショートカットを多用している。 前回は相対参照⇔絶対参照のショートカットキー「F4」を書き留めたので、今回は次 […]
Windows 11で表示されるようになったタスクバーの余計なアイコンを非表示
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先日 Windows 11 にアップグレードしてから IME でちょっとイラッときたので、この機会にタスクバーに追加された余計なアイコンも削除した。 アップグレードによってタスクバーに追加されたアイコンは下記5点（Edg […]
Windows11: 日本語IMEの削除
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先日 Windows11 にアップグレードしてから、日本語IMEも再インストールされていた。 私は Google Japanese Input の方が断然好きで、日本語IMEは要らない……。 どころか、英語との切り替え時 […]
【RStudio】environment 内のオブジェクトを一掃する
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RStudioでは、実行したオブジェクト（ベクトル、リスト、データフレームなど）はそのまま "environment" の中に残り、再利用することができる。 Emvironment に残っているオブジェクトの確認方法 こ […]
【Excel】数式の相対参照⇔絶対参照を切り替えるショートカット：F4
エクセルを使っている人達ならほぼほぼみんなお世話になっているであろう「相対参照」と「絶対参照」。 相対参照、絶対参照とは 通常、関数をコピペしたりオートフィルしたりすると、そのセルの場所から移動した分だけ自動的に計算して […]
【Rで統計】Kruskal.Wallis検定
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前回、ノンパラメトリックの2群検定の方法を書き留めておいたけど、 「よく考えたら、2群じゃなくて、2群ｘ3群の6群でみなきゃじゃん。」 とゆーことに気づき、 多重比較のデータを追加した。 各グループが正規分布じゃないこと […]
【Excel】頭文字や後ろの文字など、任意の文字を抽出
エクセルでマウスの管理をしているけど、マウスIDとは別に、実験用のID "experimental ID" を付けたい。 例えば、野生型マウス（WT）でオス（M）でSham手術（S）でインジェクションマテリアルがAD-t […]
【Rで統計】Wilcoxonの順位和検定
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あるデータのリバイスで、患者さんが最後に認知機能検査を受けた時期から亡くなるまでの期間が解析グループで差があるんじゃないか、とレビューアーから指摘された。 なので、その期間が各群で差がないことを示す検定結果をつける事に。 […]
【Rで作図】ヒストグラム
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あるデータのリバイスで、患者さんが最後に認知機能検査を受けた時期から亡くなるまでの期間が解析グループで差があるんじゃないか、とレビューアーから指摘された。 なので、その期間が各群で差がないことを示す検定結果をつける事に。 […]
【Excel】大文字、小文字、先頭のみ大文字
エクセルには、ワードに備えられている 「大文字、小文字、先頭のみ大文字 etc.」 を選択するボタンやショートカットがない。 ではどうするかというと、関数を使う。 大文字に変換：UPPER 関数 例えば、A […]
【Rデータ整理】列の追加：mutate
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Rで列を追加する時は、 dplyr::mutate() を使っている。 mutate(列A+列B) のように計算式の結果を入れられるので便利だけど、文字列を入れる時はこんな感じ ▼ 例：Data というデータフレーム内で […]
【RStudio】任意の単語etc.を全選択（VSCodeの Ctrl+L, Ctrl+D の代わりになるショートカットキーは？）
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R Studio を使っていてちょっと不便だなと思ったのが、VS Code で多用している Ctrl + Shift + L (カーソル上と同じ単語etc. を全選択) Ctrl + Shift + D (カーソル上と同 […]
【Rで作図】facet毎に色を変える
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認知機能の変化を、LBD, AD, LBD+AD グループ毎に、LATE(+)とLATE(-)で分けて示したいと思い、下記のようにグラフを作製。 ```{r fig.width=6} filter(Data, compl […]
【Rで統計】回帰分析で参照グループを指定する
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あるデータで線形混合モデルを使っていたときの話。 R の場合、参照グループは一番最初に分類されているグループと決められています。 例えば、 Group = factor(NA, levels = c("LBD-LATE( […]