【Rベーシック】データの取り込み
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エクセルのデータ etc. を R にインポートする方法。 csv ファイル etc. の取り込み エクセルデータは基本 csv ファイルで保存し、R に取り込む。 CSV ファイル CSV ファイルは、「comma S […]
Month: 2021年6月
DIAN-TU: ガンテネルマブとソラネズマブの臨床試験の結果
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家族性アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) の患者さんを対象に、薬剤の治療効果を観察する DIAN-TU 研究で、 ガンテネルマブ (Gantenerumab) ソラネズマブ (Solan […]
Visual Studio Code で R の実行環境を整える
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RStudio は、R の IDE として大変使いやすいけれど、マルチカーソルがちょっと使いづらい…… とゆーことで、VSCode で R を動かせるように設定した時の備忘録。 必要なインストール類は下記。 ＜必須＞ R […]
【VS Code】複数のPC間で設定・スニペット・拡張機能 etc. を同期する
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VS Code Ver.1.48 でリリースされた、公式の設定同期機能「Settings Sync」が凄く使いやすいと思ったので、書き留めておきます。 VS Code 「Settings Sync」で必要なもの 端末 V […]
同僚のポスドクから「あと２週間でラボを出る」と言われた件
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最近、同じラボで別グループのポスドクと、同じ部屋で実験する機会があり、時々話をしていました。 そして、先日、彼女から突然聞かれました。 「このラボで何年くらい働いているの？」 突然の質問に驚きましたが、 「 […]
Klotho-VSヘテロを持つ人達は、Aβ依存的タウの沈着および認知機能低下が少ない。
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昨年、寿命に関わる膜タンパク Klotho遺伝子 の、F352V (rs9536314) とC370S (rs9527025) の二つのミスセンス変異をヘテロで持つ人達（Klotho-VShet）はアルツハイマー病 (A […]
【R Markdown】レンダリングできないとき（openBinaryFile: invalid argument）
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先日、R Markdown を knit しようとしたら、下記メッセージがでてレンダリングできなかった。 pandoc.exe openbinaryfile invalid argument (invalid argum […]
【PowerPoint】デフォルトのテーマとデザインを設定しておく方法
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パワーポイントでプレゼン資料を作る時、私は毎回同じ設定で作っている。 で、最初にパワーポイントを開いたときから、その設定にして置いたほうが手間が少なく便利なので、私は自分用テンプレートを作って毎回それを利用している。 以 […]
Biogen のタウ抗体（Gosuranemab）の治験結果は「効果なし」
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「アデュカヌマブ」が初めてのアミロイドβ (Amyloid beta, Aβ) 抗体としてFDAの限定承認を受け、良くも悪くも注目されている Biogen ですが、 もちろん、他のアプローチによるアルツハイマー病 (Al […]
【Rで統計】正規分布の検定（シャピロ・ウィルク検定）
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Demographics を Table で出す時、 正規分布していたら 平均値と標準偏差（standard devision, SD） 正規分布していなかったら 中央値と四分位範囲（inter quartile ran […]
【Word】共著者とのやりとりに欠かせない Word 機能：「校閲」と「比較」
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論文の原稿を書いて、共著者に見てもらいたい時、「校閲」機能を使っている人は多いと思います。 この機能のおかげで、共著者達がどこを修正したのか、ひと目でわかるようになり、 修正した方がよいかオリジナルの文書の方がよいかなど […]
サマーキャンプ 2021 ……の予定
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ある日、長男 (10歳) が、 長男「今年のサマーキャンプはテニスがしてみたい。」 と言い出しました。 いつもあまり特徴のないサマーキャンプに行っていたので、子供たちはちょっと退屈だったようです。 &nbs […]
タウワクチン「AADvac1」の第二相試験の結果
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アデュカヌマブのFDA限定承認で注目を集める、アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) の免疫療法ですが、 もちろん、アミロイドβ (Amyloid beta, Aβ) だけでなく、もう一つの […]
【RStudio】パッケージを読み込めないとき
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先日、今まで普通につかえていた R Markdown ドキュメントを開いて Knit しようとしたら、途中でエラー表示がでました。 内容は、「tidyverseがインストールされていない」というもの。 Error in […]
【Photoshop】「別名で保存」が「JPEG」でできなくなった件
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ある日、Photoshop をアップデートしたら、JPEGで保存ができなくなった。 保存形式の選択肢は、 PSD PSB PDF TIF の4種類に激減…… 困って調べると、下記にその理由と対処法が載っていた……ありがた […]
外傷による核細胞質間輸送の障害がTDP-43病理を引き起こす
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「頭部外傷 (traumatic brain injury, TBI) 」には、 一回の強い外傷によって生じる頭部外傷 複数回の慢性的な外傷によって生じる脳障害 に分けられます。 後者の中に、「慢性外傷性脳症 (chro […]
【Excel】フィルター & ソート（並べ替え）機能
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今更だけど、エクセルのフィルターとソート機能って便利だな－と思うので、必要な誰かのために記録。 フィルターで要らない行を隠す 例えば下記データがあって、"D: FreezerLocation" が空欄の行は使わない場合 […]
Back to Normal
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ワクチン接種により、COVID-19 感染者数が激減しているアメリカ ▼ After a year of plotting bad news, it's nice to plot some good news. […]
ニューロンのAPOEは免疫系を介してアルツハイマー病の神経障害に寄与する
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アポリポタンパクE (Apolipoprotein E, APOE) は、孤発性アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) の最大のリスク多型ですが、その多くはアストロサイトから分泌されます [ […]
【Rベーシック】データ構造とデータ型
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データ構造とデータ型の覚え書き。 データ構造 データ構造とは データ構造とは、データがどのように入っているのかを定めるもの。 Rでは５種類のデータ構造がある。 ベクトル (Vector) 行列 (Matrix) 配列 ( […]
【Excel】空行を一括削除する方法
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先日同僚から、下記のように１行空きの状態の Excel データが送られてきた。 このまま R に取り入れるんだったら問題ないんだけど、今回は Excel のままで作業するために、空行を削除。 1,2行の場合："Ctrl […]
RCR⑥：Conflicts of Interest（利益相反, COI）
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私の所属する大学の必須トレーニングの一つに、Responsible Conduct of Research (RCR) についてのトレーニングがあります。 CITIという機関のRCRプログラムを受け、合格すると証書が与え […]
将来アルツハイマー病になるかどうか、凄い精度で診断するツール
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アルツハイマー病 (Alzheimer's disease, AD) のバイオマーカーは年々進化していっているように感じています。 私が修練医だった頃は、髄液中Aβ42/40比の有用性は報告されていたものの、たいていは神 […]
サイトスピードの向上：Google PageSpeed Insights で100点をとるまでの軌跡
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去年の夏、サイトスピードが遅いという警告があり、PageSpeed Insights で確認したら、 モバイル: 17 デスクトップ: 56 というひどい状況だった。 「なんとかせねば」と思い、ウェブ上で地 […]
【Rトラブルシュート】caret がインストールできなかった件
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caret を install.pakages ("caret") でインストールしようとしたら、 Error in install.packages : object 'caret' not found となってインス […]