以前作成した、Image Jのプロトコール。
※ Fijiのダウンロード:http://fiji.sc/Fiji
Representative Imageの作り方
1. Confocal microscopeで撮影したImageをFijiで開く。
Split channelsに☑をいれておく。
2. Image → Color → Merge Channels
3. 見せたい色のところにそれぞれのチャネルを設定。
▼ の二つに☑を入れておく。
- Create composite (それぞれのチャネルに対して操作できる)
- Keep source images
4. 画面の下にスライドバーが出てくる。
それぞれのチャネルに合わせ、
Image → Lookup Tablesで色を変える。
(補色にする。Green-Magenta, Cyan-Red, Blue-Yellow etc.)
Image → Adjust → Brightness & Contrastで明るさを調整する。
ヒストグラムの両裾野にMaximumとMinimumを合わせると良い。
(Minimumは頂点近くまで大胆に持ってくる人もいる。)
調整が終わったらApplyを押す。
5. Median Filterをかける。
Process → Filters → Median → Radiusを0 pixelsくらいにすると、
2,3pixelのノイズをとれる。
(2000 x 2000の場合はこれくらいが良い。)
6. Type → RGB colorにすると1枚の画像になる。
Image → Color → Split Channelsにすると、
個々のチャネルが出てくる。
7. それぞれFile→Save as→Tiffで保存。