2022年 今年のブレイクスルー研究(Science) 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年12月30日 Review / News 年の瀬、各誌この1年のブレイクスルーや来年の展望etc.をまとめています。 帰国後、臨床が忙しすぎて一人抄読会も全くできていませんでしたが、やっぱり Sience誌の Breakthrough of the Year だ […] 続きを読む
イキナリ受験生 更新日:2023年12月24日 公開日:2022年12月29日 日録 我が家の長男(12歳)は、アメリカでは中学生でしたが、日本に帰国したら小学6年生になりました。 ……受験生です。 正直、受験は無理だと思っていた この時期に帰国する事はだいたい予想していたので、私達両親は彼が受験したくな […] 続きを読む
マスク 更新日:2023年11月19日 公開日:2022年12月27日 日録 以前、子ども達と一緒に作ったぬいぐるみ達。 長女(10歳)はリスのぬいぐるみを「リスちゃん」、次男(7歳)はネズミのぬいぐるみを「スクワリ」と命名し、それぞれ生活用品などの小物を作って遊んでいました。 特に長女は毎日、食 […] 続きを読む
サンタさん問題-2022 更新日:2023年12月23日 公開日:2022年12月25日 日録 日本に帰国後、初めてのクリスマスです。 毎年、何らかのサンタさん問題に直面する子ども達。 今回の課題は、「サンタさんは、自分たちが日本に帰って来たことを知っているかどうか」でした。 次男(7歳)「僕はサンタ […] 続きを読む
飛行機の中にて 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年11月22日 日録 日本行きの飛行機の中。 トランジットのカナダ行きの飛行機はまとまった席がとれず、私は一人席、夫と長男(12歳)は少し離れた席、通路を挟んだ隣の席に長女(9歳)と次男(7歳)が座っていました。 怒涛の荷物整理で疲れていた私 […] 続きを読む
サインをもらいに 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年11月18日 USA研究生活 引越作業中……私は青い包みに入ったプレゼントを手に取りました。 それは、ラボでお別れ会を開催してくれた時にPIから送られたプレゼントだったのですが、バタバタしていて中身を開けていませんででした。 ―― あー […] 続きを読む
秘密のお手紙 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年11月14日 日録 私の仕事机には、手作りの可愛いメールボックスが設置されています。 いつからあるのか覚えていませんが、いつの間にやら設置されており、そこからほぼ毎日、長女(9歳)からの手紙が届きます。 手紙といっても、スティッキーノートに […] 続きを読む
箸置き 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年11月10日 日録 帰国に向けて、せっせと荷造りをしている最中、長女(9歳)から声をかけられました。 「お母さん、この箸置きも持って帰る?」 それは、長女と次男(7歳)が折り紙で作ってくれた箸置きでした。 アメリカにきて、しば […] 続きを読む
束の間のさよなら 更新日:2023年12月9日 公開日:2022年11月6日 研究生活 ラボ最後の日の翌日、バタバタと家の引っ越し準備をしていながら、私はある事が気になっていました。 ーー あー、まだ整理していないサンプルがあった。 それに、昨日はあっという間に一日が過ぎてしまって、ラボメンバー全員に御礼の […] 続きを読む
ラボ最終日 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年11月4日 研究生活 アメリカのラボの最終日。 この日は、朝から晩までとても感慨深い一日でした。 少し時間ができたので、回想しつつ、徒然書いています。 メッセージカード 朝、ラボに着くと、机の上にはいくつかメッセージカードが置かれていました。 […] 続きを読む
【Rデータ整理】1行目を列名に指定する 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月12日 R 下記のようなデータが得られて、 1行目の値を列名に宛てがいたい場合。 colnames() で列名を1行目に指定した後、1行目を削除する。 colnames(df7) <- df7[1,] df7 <- df […] 続きを読む
Words of Wisdom:by 同室のポスドク 更新日:2024年8月25日 公開日:2022年10月11日 研究生活 少し前にラボのみんながお別れ会を開いてくれましたが、それ以外にも多くの方々から、個別に食事に誘ってもらったり、時間をとってミーティングをしてもらったり、手紙をもらったりしました。 それらの中で、特に今後の成長の糧になりそ […] 続きを読む
Words of Wisdom:by 創薬部門PI 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月8日 研究生活 少し前にラボのみんながお別れ会を開いてくれましたが、それ以外にも多くの方々から、個別に食事に誘ってもらったり、時間をとってミーティングをしてもらったり、手紙をもらったりしました。 それらの中で、特に今後の成長の糧になりそ […] 続きを読む
【Rデータ整理】行の並び替え 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月7日 R 下記のようなデータフレーム(df)があり、行を昇順or降順で並べ替えたい時。 私が使いやすいと思う順で arrange() , order , sort() の使い方を書き留めておく。 dplyr::arrange() […] 続きを読む
Words of Wisdom:by 新ディレクター 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月5日 研究生活 少し前にラボのみんながお別れ会を開いてくれましたが、それ以外にも多くの方々から、個別に食事に誘ってもらったり、時間をとってミーティングをしてもらったり、手紙をもらったりしました。 それらの中で、特に今後の成長の糧になりそ […] 続きを読む
【Rデータ整理】データフレームの行と列を入れ替える 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月4日 R 下記のようなデータがあって、行と列を入れ替えたい場合。 t(データ) でOK。 df6 <- t(df5) ただこれだと行列で返ってくるので、 > class(df6) [1] "matrix" "array […] 続きを読む
Words of Wisdom:by ホープ助教 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年10月2日 研究生活 少し前にラボのみんながお別れ会を開いてくれましたが、それ以外にも多くの方々から、個別に食事に誘ってもらったり、時間をとってミーティングをしてもらったり、手紙をもらったりしました。 それらの中で、特に今後の成長の糧になりそ […] 続きを読む
【Rデータ整理】重複する列を削除 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月30日 R 下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか count(group_by()) で求めると、 Dat1 <- rea […] 続きを読む
組織について思う事 更新日:2023年5月20日 公開日:2022年9月29日 研究生活 Co-PIのメモリアルシンポジウムの前夜、私はシンポジウムに参加するために日本からやってこられたA先生と話をする機会がありました。 はじめは普通の世間話をしていましたが、途中からかなり突っ込んだ内容になりました。 その際 […] 続きを読む
久しぶりの個人ミーティング-3 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月27日 研究生活 数ヶ月に及んだマウスの手術も一区切りつき、私は久しぶりにPIとの個人ミーティングをセッティングしてもらいました。 それまでの数ヶ月間は、2種類の手術や行動解析などで、ほとんど時間が取れず、私は個人ミーティングにもグループ […] 続きを読む
【Rデータ整理】特定の条件を満たす行数をカウント 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月26日 R 例えば、下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか知りたい時。 count(group_by()) で求める。 Dat1 […] 続きを読む
チャンピオンカップ 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月25日 USA 帰国に向けて、自宅の物品整理中、棚に飾られている2つの小ささなチャンピオンカップが目に止まりました。 長女(9歳)が夏休み前の "Survival Week" でゲットしたチャンピオンカップです。 "Survival W […] 続きを読む
メモリアルシンポジウム当日 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月23日 研究生活 バタバタしながら迎えた金曜日。 午前中には、プレゼンテーター達の何人かがラボを訪れると聞いていましたが、私にはちょっとお腹いっぱいだったので、ラボには顔を出さず、ちょっと遅れて出勤し、直接会場に向かいました。   […] 続きを読む
【ImageJ/Fiji】イメージサイズ(解像度)を変更 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月22日 ImageJ / Fiji コントラストの変更、切り抜きを行った後に、イメージサイズを変更する。 イメージサイズの変更 スタート時点でのイメージサイズは、200 px ✕ 200 px。 これをサイズダウンしてみる。 Image > Adju […] 続きを読む
【Rで作図】グラフの背景を変更する 更新日:2024年9月22日 公開日:2022年9月22日 R 下のようなグラフがあって、この背景を変更したいとき。 themeで変更する。 グラフの背景の変更 白 theme_classic() グレー+格子(白) theme_gray() 白+格子(グレー) theme_bw() […] 続きを読む
【Rで作図】レジェンドのタイトルを消す 更新日:2024年9月21日 公開日:2022年9月21日 R ggplot2でグラフを作っていて、「レジェンドは要るけど、レジェンドタイトルは消したいな」と思って消した時の備忘録。 使う関数は「theme」のlegend.title = element_blank。 theme(l […] 続きを読む
ネズミさん騒動 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月19日 USA アメリカの今のアパートに引っ越してきて、4年目に突入した頃のある日の事。 夕方リビングでテレビを見ていた次男(当時6歳)が、 「僕、今、ねずみさんを見た気がする。」 と、話しかけてきました。 次男の目撃情報はあまり信用さ […] 続きを読む
【ImageJ/Fiji】画像の切り抜き 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月18日 ImageJ / Fiji 前回コントラストを調節した画像から、一部分を切り抜いてみる。 切り取る部分を選択 rectangle ツールで切り取りたい部分を選択する。 この時、ツールボックスの表示を確認しながら、目的の大きさ、形を選択する(今回は、 […] 続きを読む
メモリアルシンポジウム前夜 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月15日 研究生活 故Co-PIのメモリアルシンポジウム前夜。 招待されたプレゼンテーター達が集まって食事会が開かれました。 昼間はオサレ服でマウスと戯れ 「何を着ていけば……」 と、朝から悩みました。スーツ?ドレス?普段着? よくわからな […] 続きを読む
メモリアルシンポジウム前々日 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月14日 研究生活 先月末で、予定していたマウスの手術が全て終了し、やっと一息ついて……と言いたいところですが……相変わらず追われていますorz... ちょっと頭を整理するために何に追われているか洗い出してみると、 プライベート 引っ越しに […] 続きを読む
【ImageJ/Fiji】画像のコントラストを変更 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月14日 ImageJ / Fiji Fiji/ImageJで画像のコントラストを変更する。 (論文ではMethodsに記載する必要がある。) 画像の取り込みと確認 生データをFijiで取り込む 顕微鏡で撮影した画像の生データをFijiで取り込む。 (今回は […] 続きを読む
Farewell Party 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月12日 研究生活 ラボの最終日が近づいてきたある日の事、同僚達が私達夫婦のFarewell Partyを開いてくれました。 当日は、PIがピザを注文してくれて、有志の人達が手作りのお菓子やジュースを持ってきてくれました。 午 […] 続きを読む
ジャーナルから “photoshopで画像のコントラストを調節したら駄目ですよ” と指摘された件 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月11日 研究生活ImageJ / Fijiphotoshop 先日、投稿先のジャーナルから 「レビューアーのレビューは終わったんだけど、ジャーナルのルーチンチェックで画像に懐疑的な問題が指摘されたので、対応してください。」 という旨のメールが届き、一気に心拍数が上昇しました。 ―― […] 続きを読む
【Rで作図】facet のタイトルのフォントサイズを変更 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月10日 R グラフを作っていて、「Facetのタイトルのフォントサイズを変更したい」と思って消した時の備忘録。 themeに"strip.text = element_text(size = ○○)"でサイズを指定すればOK。 th […] 続きを読む
折り鶴自慢 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月7日 USA 我が家の長男(12歳)は折り紙が得意ですが、 いつも褒められている彼の傍らで、密かに闘志を燃やしていた次男(7歳)。 「僕も折り紙が上手になりたい!」 と言って、面倒くさがる長男に頼み込んで折り紙の折り方を教えてもらって […] 続きを読む
【Photoshop】矢印つきのラインを描く 更新日:2023年5月11日 公開日:2022年9月6日 photoshop この間、フォトショで矢印ラインの描き方を忘れていたので備忘録。 1.ツールバーでラインを選択。 2.画面上に出てくるオプションツール(なければ、Window → Option で表示させる。)で、ラインが選択されているこ […] 続きを読む