ママ研究者の雑記帳

3人の子持ち研究員の、海外・研究・育児生活あれこれ

「Rで作図」の記事一覧

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【Rで作図】棒グラフにプロットを重ねる

最近はどのジャーナルからも「棒グラフにはプロットを重ねるように」と言われると思う。 私自身、プロットしていないと気持ちが悪い。 で、その方法 ↓ 棒グラフにプロットを重ねる 棒グラフだけだと mean とかのデータを使う […]
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【Rで作図】エラーバーを追加する

とある棒グラフを作成。 このグラフにエラーバーを付けたい場合、 geom_errorbar() を追加する。 エラーバーをつける 標準偏差(standard deviation, SD) SDは、 dplyr::summ […]
ggplot-2

【Rで作図】ggplot の基本概念

ggplot (ggplot2) では色々なグラフがかけるけど、基本概念は「レイヤー構造」で作る、という事。 イメージは photoshop や illustrator のレイヤーと似てる。   ggplot( […]
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【Rで作図】ヒストグラム

あるデータのリバイスで、患者さんが最後に認知機能検査を受けた時期から亡くなるまでの期間が解析グループで差があるんじゃないか、とレビューアーから指摘された。 なので、その期間が各群で差がないことを示す検定結果をつける事に。 […]
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【Rで作図】EPSファイルやsvgファイルで出力

R は色々なグラフィックスが作れて嬉しくなる。 作成した図表をそのまま R Markdown で出力できるのも魅力の一つだが、場合によっては、別のソフトで編集したいときも。   私の場合、Figures 等を作 […]
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【Rで作図】バイオリン・プロット(Violin plot)

データをグラフにするとき、 「これのデータは バイオリン プロット で表すのが最適。」 と思う時があります。 今回は、それを R で作るときの備忘録。 ggplot2 のインストール ggplot2 は、“The Gra […]