【Rデータ整理】文字列の結合:str_c/paste/paste0 更新日:2024年12月15日 公開日:2021年10月27日 R 文字列を繋げるときには、paste(), paste0(), str_c()などを使う。 paste()とpaste0()は、Rの標準パッケージ(base)。 str_c()は、stringrパッケージの関数。 str_ […] 続きを読む
【Rデータ整理】文字列の中に数式を入れたい場合:str_c/paste 更新日:2024年12月15日 公開日:2021年10月17日 R 例えば作表の際、列名に「(N = 数字)」という情報をいれたくて、数値は計算式で出したい場合、 stringr::str_c() 文字列操作は Hadley氏作製の stringr パッケージで完結できる。 string […] 続きを読む
【Rデータ整理】NAを無視して計算する:na.rm = TRUE 更新日:2022年5月13日 公開日:2021年10月13日 R Rにはベクトル専用の関数が多く用意されている。 例えば、 sum() :合計を求める mean() :平均値を求める median() :中央値を求める etc. この時注意したいのが、データフレーム内に「 […] 続きを読む
【Rデータ整理】2つの要素をまとめて、新しい列に追加する:fct_collapse 更新日:2024年10月19日 公開日:2021年10月5日 R 例えば、あるデータ(Data)内に Alzheimer's disease neuropathologi change (ADNC) の項目があり、 そのデータフレームに ADNC="Not" と ADNC="Low" […] 続きを読む
【Rデータ整理】小数点以下を0.00とかに揃えたい場合 更新日:2021年11月14日 公開日:2021年10月3日 R R で小数点第○○位まで出したい、というときは、Excel でもおなじみの Round 関数が使える。 round(データ, 桁数) round(0.12345, 3) output 0.123 ただこれだと、小数点以下 […] 続きを読む
【Rデータ整理】スコア “1+, 2+…” を数値 “1, 2…” に変換し、データ型を数値型に変更 更新日:2022年5月12日 公開日:2021年9月25日 R 相変わらず R でデータ整理中。 今回は、データベースに記載されている 1+, 2+ などのスコアを数値 1, 2... に変換し、データ型を数値型に変更する方法。 データベースから落としてきたときは、下記のようになって […] 続きを読む
【Rデータ整理】列名とデータ型の変換 更新日:2023年3月30日 公開日:2021年9月13日 R R にデータを取り込んで、そこから最初に行う作業の備忘録。 データのインポート 私は、データベースからエクセル (.xlsx) でデータを取得し、それを R に取り込む場合が多い。 エクセルの取り込みは、 readxl: […] 続きを読む
【Rデータ整理】データフレームの結合 : join 更新日:2024年10月19日 公開日:2021年9月9日 R 最近リバイスが返ってきて、データ整理に追われ中…… n数を増やす目的等で他から持ってきたデータを結合させた時の備忘録。 dplyr::join dplyr パッケージの join 関数を使う。 join 関数は4種類。 […] 続きを読む
【Rデータ整理】データフレームの行名と列名を変更:rownames/rename/colnames 更新日:2024年10月19日 公開日:2021年9月1日 R 下記のようなデータフレームがあり、この表の行名(左側の列)と列名(一番上のヘッダー行)とを変更したい場合。 Estimate Std. Error Pr(>|z|) OR CI_low CI_high (Inter […] 続きを読む
【Rデータ整理】Factor 内の順序を入れ替える 更新日:2021年11月14日 公開日:2021年8月1日 R 例えば下記のように、 症例の年齢 Alzheimer's Disease Neuropathologic Change (ADNC) で10症例のデータフレームを作った場合。 Age <- c(65, 72, 82 […] 続きを読む
【Rデータ整理】文字の置換:gsub/sub/str_replacement/str_replacement_all 更新日:2024年12月15日 公開日:2021年7月12日 R とある csv データを取り込み…… Data1 <- read.csv("Dataset.csv") 「str()」で確認すると、 数値になっていてほしいところが、文字列で認識されている。 これはなんでかというと […] 続きを読む
【Rデータ整理】factor と numeric の変換 更新日:2022年4月16日 公開日:2021年7月8日 R これからデータ整理の色々と書き留めていく予定。 まず、とあるcsv データを取り込み。 取り込みの方法は下記 ▼ Data1 <- read.csv("Dataset.csv") 「str()」で確認すると、 fa […] 続きを読む