【SSHトラブルシュート】permission denied
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/etc/ssh/sshd_configで SSH の設定ファイルを開こうとしたら、拒否された。 /etc/ssh/sshd_config: Permission denied 原因によって、いくつかトラブルシュートの方 […]
「備忘録集」の記事一覧
【Dockerトラブルシュート】Error: unable to delete image (cannot be forced) – image is being used by running container
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Docker のイメージ harpooncorp/harpoon-ext を削除しようとしたら、"Delete the container that's using it and try again" という警告が出てき […]
【Rベーシック】[ ] (square brackets) を使って各要素にアクセスする
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Vector、Matrix、DataFrame、List etc. から [] (square brackets) を使って特定の要素へアクセスする方法。 ベクトル (Vector) の場合 Vectorを作る。 v & […]
【Windows】IPアドレスの確認方法／サブネットマスク／デフォルトゲートウェイ
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Linux で IP アドレスを確認する方法をメモったので、 ついでにWindowsのも書き留めておく。 コマンドプロンプトを使ってIPアドレスの情報を取得 Win + R で "Run" ウィンドウを開く。 検索欄に […]
【Linux】IP address の確認方法
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Linux で IP アドレスを確認する方法。 私は Ubuntu 22.04 LTS を使用している。 以前は ifconfig が使えてたけど、Ubuntu 18 Ver.以降はデフォルトでは使えなく […]
NASの設定 (Synology)
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研究室に戻ってきて、少しずつセットアップを進めつつある今日この頃。 今日は、イメージデータ保存のためのNASのセットアップを行った……ので、せっかくなので備忘録。 Network-Attached Storage (NA […]
【Synology】 ユーザーIDとパスワードをリセット
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帰国後、以前セッティングしていた Synology NAS のユーザーIDとパスワードを忘れてしまっていて、さらにどこにもメモっていなかった……orz。 ……このままでは前に進めないので、下記方法でリセットした。 Syn […]
【Synology】 インターネット経由でDSMのセッティングができなかった件
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帰国後、ラボで Synology のセッティングをしようとしたけど、ブラウザのアドレスバーに「find.synology.com」と入れても、 LAN内にあるはずのSynology DS218j を認識してくれなかった。 […]
【Synology】DSM のアップグレード
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帰国後、Synology のセットアップ中。 久しぶりに Synology のアカウントを開いたら、DSM のバージョンが古かったのでアップデートした。 DSM のアップグレード：コントールパネルから コントロールパネル […]
仮想マシンの保存場所を変更する
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先日、Hyper-V で仮想マシンを作成したけど、保存場所の初期設定が 構成ファイル：C:¥ProgramData¥Microsoft¥Windows¥Hyper-V フォルダ内 仮想ハードディスク：C:¥Users¥P […]
Hyper-V仮想マシンにUbuntu22.04を入れる
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RStudio Server を利用したくなったけれども、RStudio Server で必要な OS は Linux。 なので、仮想マシンに Linux distributions の何かを入れて、そこに RStudi […]
【RStudio Server】Ubuntu で RStudio Server の構築
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以前、RStudio Cloud を導入して使用していたが、使用限度などの問題があり、なんだかんだと使い辛さを感じるようになってきた。 なので、しばらく敬遠していた RStudio Server 環境作りに着手することに […]
仮想化システムについてのまとめ
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仮想化・仮想サーバーについての覚書。 仮想化 (Virtualization) とは 仮想化とは、物理的な環境にとらわれることなく、ハードウェアに含まれるCPU、メモリなどのリソースを倫理的に分割・統合する技術のことで、 […]
Linux についてのまとめ
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Linuxについての覚書。 Linux とは Linux とは、Windows や Mac OS と同じ Operating system (OS) の一種。 Windows や Mac OS などの OS は有料だけど […]
Windows10/11: 時刻を設定する
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アメリカから帰国してしばらく経ったある日の事、子供から「PCの時刻を設定し直して。」と頼まれた。 画面を見ると、時刻設定がアメリカのまま。 夕方なのに明け方の時間になっている。 「OK。」 と二つ返事でOKし、日付のとこ […]
【QuPath】スキャナ画像を取り込んで観察する
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QuPath でスキャナイメージを観察する方法 (基本)。 スキャナ画像のインポート 画面左側にある "Create project" をクリックすると、 フォルダーの作成が要求される。 プロジェクトを作成したい場所に新 […]
【QuPath】QuPathのインストール
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以前まではHaloでスキャナ画像の解析をしていたけど、 異動先のラボではHaloを導入していなかった……とゆーことで、フリーソフトのQuPathを使う事に。 せっかくなので、方法等を随時書き留めていく事に。 […]
変更したCSSが、キャッシュ機能のために反映されないときの対処法
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先日、Prism.jpのThemeを変更し、サーバーにアップロードしたけど、CSSが反映されなかった。 最終的に、Chromeのキャッシュを削除したら解決したので、それらの備忘録。 キャッシュ機能とは キャッシュ機能とは […]
【Rで統計】正規分布とrnorm, dnorm, pnorm, qnorm
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Rを使った正規分布関連の覚書。 正規分布 (normal distribution) とは 正規分布とは、平均値と最頻値・中央値が一致し、それを軸として左右対称となっている確率分布。 多くの統計的手法において、データが正 […]
【Rベーシック】If 構文
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if 構文、if else 構文、if else if 構文の覚書。 If 構文 iF 構文は、他の反復 構文と同じく、 if (条件){処理} で表す。 例1：rnorm の標準正規分布で出てきた数値が正 […]
【Rベーシック】空ベクトル etc.を作る
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データフレームの要素などにあてがう時は、空vectorなどを先に作っておき、そこに処理結果を書き込むようにする。 空のvectorやlistを作る場合は、 vector() 、data frameの場合は matrix( […]
【Rベーシック】For ループ
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For ループは「仕事を反復 (iterate) する」ループ機能の一つ。 for(条件){処理} で表す。 前回紹介した While ループと違うのは、()内に繰り返す回数が入る事。 For ループの書き方と Whil […]
【Rベーシック】While ループ
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while ループでは、ある条件式が与えられると、その条件式が偽になるまで処理を繰り返し続ける構文。 while(条件){処理} で表す。 Rではapplyファミリーで代用できるし、速度も遅いので、他の言語ほどは whi […]
【Google日本語入力】数値入力の初期設定を半角にする
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Google日本語入力で数値を打ち込む時、デフォルトは全角。 でも、2桁以上の場合は半角が良いと思う……ので、「数値設定を半角にする方法」の覚書。 Google日本語入力 の数値入力の初期設定を半角にする方法 1．右下の […]
【Rベーシック】リスト (List) を作る
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リストは異なるデータ構造を複数個格納することができるデータ構造の事。 Vector, Matrix, DataFrameなども混ぜて格納できる。 リスト (List) を作る list はlist()で作成する。 my_ […]
【Rベーシック】データフレーム (Data Frame) を作る
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データフレーム (data frame) の作り方色々。 データフレーム (Data Frame) とは データフレームは list の２次元バージョン。 データサイエンスで最も多く使用される。 データフレームにはここの […]
【Rベーシック】行列 (Matrix) を作る
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行列 (Matrix) の作り方。 行列 (Matrix) とは matrix は線形代数の行列と同じように、２次元配列に値を格納する。 Matrix を作る 行を指定する場合 matrix を作る時は、行 […]
【Rベーシック】ベクトル (Vector) を作る
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ベクトル (vector) の作り方。 ベクトル (Vector) とは vector は１次元ベクトルとして値を格納する。 イメージは、「１列のデータセット」。 例えば、下記の場合、Boxの中にそれぞれ数値が入っている […]
【Rデータ整理】列の抽出／削除／並び替え：select
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例えば下記データ（Data_c）がある。 X ID Cohort Sex Age ADNC 1 1 232493 LBD Male 83 Low 2 2 326342 AD Male 78 High 3 3 326322 […]
【Rデータ整理】データの中身（構造）を確認する：str
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データをインポートしたらまず始めにする作業。 今回は、同じ階層にある"my_Data"というエクセルファイルをインポート library(readxl) Data_C <- readxl::read_xlsx(". […]
【Rデータ整理】１行目を列名に指定する：colnames
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下記のようなデータが得られて、 １行目の値を列名に宛てがいたい場合。 colnames() で列名を１行目に指定した後、１行目を削除する。 colnames(df7) <- df7[1,] df7 <- df […]
【Rデータ整理】行の並び替え：arrange／order／sort
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下記のようなデータフレーム(df)があり、行を昇順or降順で並べ替えたい時。 私が使いやすいと思う順で arrange() , order , sort() の使い方を書き留めておく。 dplyr::arrange() […]
【Rデータ整理】データフレームの行と列を入れ替える：t／as.data.frame
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下記のようなデータがあって、行と列を入れ替えたい場合。 t(データ) でOK。 df6 <- t(df5) ただこれだと行列で返ってくるので、 > class(df6) [1] "matrix" "array […]
【Rデータ整理】重複する列を削除：distinct
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下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか count(group_by()) で求めると、 Dat1 <- rea […]
【Rデータ整理】特定の条件を満たす行数をカウント
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例えば、下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか知りたい時。 count(group_by()) で求める。 Dat1 […]
【ImageJ/Fiji】イメージサイズ（解像度）を変更
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コントラストの変更、切り抜きを行った後に、イメージサイズを変更する。 イメージサイズの変更 スタート時点でのイメージサイズは、200 px ✕ 200 px。 これをサイズダウンしてみる。 Image > Adju […]