【QuPath】Thresholdで二値化して陽性部分の面積を求める
例えば、このマウスのIHC画像。 海馬と皮質の部分をそれぞれannotationして、二値化してDAB染色陽性部分の面積を測定したい。 アノテーションを作成する まずは、計測したいエリアを選択して、アノテーションを作成する。 左タブから「Annotations」タブを選択。 アノテーション作成によく使うのは、赤枠で囲った「Brush」ツールと「Wand」ツール。 まずはWandツールを使って、輝度 […]
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