【Rデータ整理】重複する列を削除
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下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか count(group_by()) で求めると、 Dat1 <- rea […]
Month: 2022年9月
久しぶりの個人ミーティング－３
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数ヶ月に及んだマウスの手術も一区切りつき、私は久しぶりにPIとの個人ミーティングをセッティングしてもらいました。 それまでの数ヶ月間は、２種類の手術や行動解析などで、ほとんど時間が取れず、私は個人ミーティングにもグループ […]
【Rデータ整理】特定の条件を満たす行数をカウント
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例えば、下記のようなデータがあって、 "Deceased" が "True" と "False" と入力されている症例がそれぞれどれくらいずつあるか知りたい時。 count(group_by()) で求める。 Dat1 […]
メモリアルシンポジウム当日
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バタバタしながら迎えた金曜日。 午前中には、プレゼンテーター達の何人かがラボを訪れると聞いていましたが、私にはちょっとお腹いっぱいだったので、ラボには顔を出さず、ちょっと遅れて出勤し、直接会場に向かいました。   […]
【ImageJ/Fiji】イメージサイズ（解像度）を変更
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コントラストの変更、切り抜きを行った後に、イメージサイズを変更する。 イメージサイズの変更 スタート時点でのイメージサイズは、200 px ✕ 200 px。 これをサイズダウンしてみる。 Image > Adju […]
【ImageJ/Fiji】画像の切り抜き
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前回コントラストを調節した画像から、一部分を切り抜いてみる。 切り取る部分を選択 rectangle ツールで切り取りたい部分を選択する。 この時、ツールボックスの表示を確認しながら、目的の大きさ、形を選択する（今回は、 […]
メモリアルシンポジウム前夜
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故Co-PIのメモリアルシンポジウム前夜。 招待されたプレゼンテーター達が集まって食事会が開かれました。 昼間はオサレ服でマウスと戯れ 「何を着ていけば……」 と、朝から悩みました。スーツ？ドレス？普段着？ よくわからな […]
メモリアルシンポジウム前々日
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先月末で、予定していたマウスの手術が全て終了し、やっと一息ついて……と言いたいところですが……相変わらず追われていますorz... ちょっと頭を整理するために何に追われているか洗い出してみると、 プライベート 引っ越しに […]
【ImageJ/Fiji】画像のコントラストを変更
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Fiji/ImageJで画像のコントラストを変更する。 （論文ではMethodsに記載する必要がある。） 画像の取り込みと確認 生データをFijiで取り込む 顕微鏡で撮影した画像の生データをFijiで取り込む。 （今回は […]
Farewell Party
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ラボの最終日が近づいてきたある日の事、同僚達が私達夫婦のFarewell Partyを開いてくれました。 当日は、PIがピザを注文してくれて、有志の人達が手作りのお菓子やジュースを持ってきてくれました。 午 […]
ジャーナルから “photoshopで画像のコントラストを調節したら駄目ですよ” と指摘された件
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先日、投稿先のジャーナルから 「レビューアーのレビューは終わったんだけど、ジャーナルのルーチンチェックで画像に懐疑的な問題が指摘されたので、対応してください。」 という旨のメールが届き、一気に心拍数が上昇しました。 ―― […]
【Rで作図】facet のタイトルのフォントサイズを変更
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グラフを作っていて、「Facetのタイトルのフォントサイズを変更したい」と思って消した時の備忘録。 themeに"strip.text = element_text(size = ○○)"でサイズを指定すればOK。 th […]
【Photoshop】矢印つきのラインを描く
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この間、フォトショで矢印ラインの描き方を忘れていたので備忘録。 １．ツールバーでラインを選択。 ２．画面上に出てくるオプションツール（なければ、Window → Option で表示させる。）で、ラインが選択されているこ […]
【Rで作図】レジェンドを消す
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グラフを作っていて、「レジェンド要らないな」と思って消した時の備忘録。 方法はいくつかあるけど、使い勝手が良かったのは、themeに "legend.position = "none"を追加する方法。 theme(leg […]