【Rトラブルシュート】csvで書き出すとき遭遇したトラブル
あるコードをcsvで書き出し、 # CSV で書き出し write.csv(Data, "file_name.csv", row.names = FALSE) それを別アプリで開こうとすると、下記エラーメッセージが出現した。 でも、エクセルから保存した csv ファイルは普通に work する……。 で、Rから write.csv() で出力したファイルをエクセルで開き、そのまま . […]
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2022年7月
タウの “マスター” リン酸化部位
Alzheimer’s disease（AD）の主要病理の一つ、過リン酸化タウ。 タウには、リン酸化、ユビキチン火、アセチル化、メチル化、SUMO化、糖化……と、様々な翻訳後修飾（post-translational modification, PTM）が報告されており [1]、ADにおけるPTMの経時変化についても、色々と調べられてきました [2]。 その中でも特にリン酸化タウに関し […]
【Rトラブルシュート】the condition has length > 1 and only the first element will be used
R で if 構文を使うときに時々遭遇する下記エラーメッセージ。 the condition has length > 1 and only the first element will be used 例えば、下記のようなデータフレームで、 “Region” 列の “Ctx-” の “-” だけ取り除きたいと思った時、 […]
アンダーライン色々：通常下線、太め、マーカー風、波線、２重線
文字に下線を引く際の色々。 普通の下線: <u> 普通の下線だったら <u> で。 <u>下線を引きます</u> output 下線を引きます 下線のバリエーション①: border-bottom 下線部を太くしたり、色を変えたり etc.には、 <span style="border-bottom:> で色々設定してあげると良い。 例え […]
【Rで統計】カイ二乗検定
カイ二乗検定とは カイχ二乗検定というと、一般にピアソンのカイ二乗検定を指す事が多い。 仮説によって、適合度検定や独立性の検定などがある。 基本はｔ検定と似ているけれど、ｔ検定が「２つの群の連続変数（numerical variable）の平均値の比較検定」（帰無仮説（null hypothesis）は、「平均値に差がない」）を検証するのに対して、 カイ二乗検定は「２群間のカテゴリカル変数（cat […]
“細胞外” のAβプラークの起源は “細胞内” のオートリソソームだった
「オートファジー」は、生態系の恒常性を維持する為になくてはならないものであり、アルツハイマー病（Alzheimer’s disease, AD）を含む数々の変性疾患でオートファジー機能障害との関連性が示唆されています [1]。 ミスフォールドされたタンパクは、ユビキチン・プロテアソーム系（ubiquitin proteasome system, UPS）やマクロオートファジー、シャペロ […]
【RMarkdownトラブルシュート】openBinaryFile: permission denied (Permission denied)
前回、”openBinaryFile: invalid argument” の問題は絶対パスを指定することで解消したけど、 次に出てきたエラーメッセージは、 openBinaryFile: permission denied (Permission denied) あれ？なんで拒否られるの？ と思いながら検索すると、下記に答えが。 This might see […]
【RStudio】基本言語を変更
この間、R と RStudio でバグが起こって全インストールし直したら、エラーメッセージが日本語に変わっていた。 どうやら、再インストールする時に疲れていて言語選択をスキップしてたみたい……。 別に日本語でも良いのだけれど、英語に慣れてしまったので、下記指示を入れて英語に変更。 Sys.setenv(LANG = "en") 無事、英語に戻せた。
【トラブルシュート】package or namespace load failed for ‘tidyverse’ in loadNamespace と Error in app$vspace(new_style$`margin-top` %||% 0) : attempt to apply non-function
ある日、Rを使っていて、突然 “tidyverse” が使えなくなった。 Error: package or namespace load failed for ‘tidyverse’ in loadNamespace まずは下記に倣って、 “rlang” の再インストールを試みた。 remove.packages("rlang") i […]
【Rデータ整理】クロス集計表
カテゴリデータの集計表⇔データフレームの切り替え。 クロス集計表 例えば、 運動あり 運動なし 認知症あり 10 15 認知症なし 20 5 のようなデータの集計表を作る時。 基本は行列で作る。 行列（matrix）で作る場合 行列で作る場合は下記。 # クロス集計表を作る x < matrix(c(10, 15, 20, 5), byrow=TRUE, ncol=2) dimnames(x […]